More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2318 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  100 
 
 
375 aa  744    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  78.72 
 
 
402 aa  586  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  72.15 
 
 
376 aa  541  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  71.62 
 
 
376 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  71.62 
 
 
377 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  71.96 
 
 
378 aa  539  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  71.88 
 
 
377 aa  533  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  72.15 
 
 
377 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  71.62 
 
 
377 aa  530  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  69.41 
 
 
385 aa  523  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  71.09 
 
 
377 aa  511  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  71.09 
 
 
377 aa  511  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  68.44 
 
 
377 aa  507  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  67.46 
 
 
379 aa  501  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  68.41 
 
 
376 aa  498  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  66.05 
 
 
377 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  66.31 
 
 
377 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  65.54 
 
 
384 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  65.54 
 
 
384 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  64.55 
 
 
379 aa  474  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  60.11 
 
 
378 aa  457  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004160  flagellin protein flaE  48.4 
 
 
374 aa  354  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000739786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01302  flagellin  48.93 
 
 
374 aa  353  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  47.89 
 
 
393 aa  335  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  47.52 
 
 
394 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  45.11 
 
 
387 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  40.99 
 
 
405 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  40.36 
 
 
392 aa  266  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  45.6 
 
 
319 aa  263  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  38.85 
 
 
395 aa  256  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  44.39 
 
 
319 aa  252  7e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  40 
 
 
390 aa  238  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  40 
 
 
390 aa  238  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  37.99 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  41.6 
 
 
274 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  37.62 
 
 
404 aa  229  9e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  68.29 
 
 
485 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  68.29 
 
 
484 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  40.16 
 
 
380 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  37.37 
 
 
375 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  66.27 
 
 
468 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  65.66 
 
 
467 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  37.44 
 
 
431 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  36.23 
 
 
462 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  65.84 
 
 
481 aa  219  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  39.84 
 
 
356 aa  219  7.999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  46.15 
 
 
488 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0766  flagellin domain-containing protein  38.99 
 
 
376 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  61.05 
 
 
517 aa  217  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  35.32 
 
 
383 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  63.98 
 
 
482 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  37.28 
 
 
390 aa  212  7.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  35.86 
 
 
437 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  60 
 
 
516 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  38.9 
 
 
369 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  38.9 
 
 
369 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  35.06 
 
 
420 aa  209  8e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  36.8 
 
 
327 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  58.68 
 
 
492 aa  206  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  37.31 
 
 
386 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  37.06 
 
 
404 aa  202  9e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  62.42 
 
 
687 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  35.21 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  36.18 
 
 
384 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  36.18 
 
 
384 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  53.3 
 
 
272 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  53.3 
 
 
272 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  62.11 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  36.38 
 
 
422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  62.11 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  36.2 
 
 
373 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  49.78 
 
 
271 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  35.88 
 
 
379 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  49.78 
 
 
271 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  60.87 
 
 
294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  37.56 
 
 
412 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0223  flagellin  36.9 
 
 
389 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778808  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  61.49 
 
 
271 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  61.49 
 
 
271 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  61.11 
 
 
274 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  35.68 
 
 
389 aa  194  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  41.04 
 
 
483 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  54.55 
 
 
273 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  53.76 
 
 
273 aa  193  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  56.89 
 
 
490 aa  193  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  60.49 
 
 
274 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  62.11 
 
 
294 aa  193  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  44.49 
 
 
494 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  53.72 
 
 
272 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1476  flagellin domain-containing protein  34.39 
 
 
391 aa  191  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  55.31 
 
 
270 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  57.49 
 
 
492 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  51.04 
 
 
506 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  54.14 
 
 
475 aa  189  7e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  56.02 
 
 
493 aa  189  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  58.64 
 
 
275 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  58.64 
 
 
275 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  54.82 
 
 
501 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  58.02 
 
 
273 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  58.64 
 
 
273 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>