190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2269 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2269  outer membrane protein transport protein  100 
 
 
415 aa  848    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00153589  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03124  hypothetical protein  54.61 
 
 
420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0561  long-chain fatty acid transport protein  54.69 
 
 
428 aa  451  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002852  long-chain fatty acid transport protein  53.12 
 
 
419 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3634  long-chain fatty acid transport protein  49.66 
 
 
428 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000535062  hitchhiker  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000778  long-chain fatty acid transport protein  44.52 
 
 
432 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2771  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  42.4 
 
 
434 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000776056  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1618  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  42.79 
 
 
440 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000079524  decreased coverage  0.00000000170841 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3037  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  42.7 
 
 
441 aa  342  7e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000400429  normal  0.0267167 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2178  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  42.73 
 
 
440 aa  341  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000636439  normal  0.0847993 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1462  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  43.31 
 
 
431 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00212901  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2436  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  41.04 
 
 
438 aa  339  4e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000365967  hitchhiker  0.00491561 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2470  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  42.25 
 
 
445 aa  339  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000167182  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2609  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  40.27 
 
 
439 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000112018  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1397  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  42.63 
 
 
431 aa  336  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00928382  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1450  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  42.69 
 
 
428 aa  334  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000153151  unclonable  0.0000000000946875 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2687  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  43.76 
 
 
427 aa  333  4e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000955558  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2791  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  41.48 
 
 
438 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000898305  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1587  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  41.26 
 
 
438 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000318349  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3099  long-chain fatty acid transport protein, putative  41.56 
 
 
440 aa  329  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2866  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  42.63 
 
 
433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0131226  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1414  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  41.01 
 
 
443 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000739159  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2824  long-chain fatty acid outer membrane transporter  38.07 
 
 
427 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1338  long-chain fatty acid outer membrane transporter  39.44 
 
 
417 aa  277  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2600  long-chain fatty acid outer membrane transporter  37.59 
 
 
422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1506  long-chain fatty acid outer membrane transporter  39.03 
 
 
421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0138985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1397  long-chain fatty acid outer membrane transporter  39.03 
 
 
421 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0385  long-chain fatty acid outer membrane transporter  39.03 
 
 
421 aa  266  7e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0698  long-chain fatty acid transport protein  36.21 
 
 
419 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1441  long-chain fatty acid outer membrane transporter  36.62 
 
 
415 aa  260  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3839  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  36.01 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4232  long-chain fatty acid transport protein  35.03 
 
 
437 aa  250  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1548  outer membrane protein P1  35.43 
 
 
453 aa  249  4e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000809472  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3381  long-chain fatty acid outer membrane transporter  33.55 
 
 
440 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0374  long-chain fatty acid transport protein  34.04 
 
 
412 aa  247  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05817  hypothetical protein  35.73 
 
 
414 aa  246  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2620  long-chain fatty acid outer membrane transporter  33.04 
 
 
437 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0208452  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2634  long-chain fatty acid outer membrane transporter  33.04 
 
 
437 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0127967  hitchhiker  0.00000000000285546 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2745  long-chain fatty acid outer membrane transporter  33.04 
 
 
435 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00852795  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2580  long-chain fatty acid outer membrane transporter  33.04 
 
 
435 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00696507  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2531  long-chain fatty acid outer membrane transporter  33.04 
 
 
435 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3487  long-chain fatty acid outer membrane transporter  33.62 
 
 
446 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2724  long-chain fatty acid outer membrane transporter  33.62 
 
 
446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02268  long-chain fatty acid outer membrane transporter  33.62 
 
 
448 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1313  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  33.62 
 
 
446 aa  240  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02229  hypothetical protein  33.62 
 
 
448 aa  240  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2640  long-chain fatty acid outer membrane transporter  33.62 
 
 
446 aa  240  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1309  long-chain fatty acid outer membrane transporter  33.62 
 
 
446 aa  240  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.613202  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2503  long-chain fatty acid outer membrane transporter  33.48 
 
 
446 aa  239  9e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2495  long-chain fatty acid outer membrane transporter  33.41 
 
 
446 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000183  long-chain fatty acid transport protein  35.27 
 
 
414 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0205909  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2884  long-chain fatty acid outer membrane transporter  32.82 
 
 
444 aa  238  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576882  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0372  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  33.26 
 
 
448 aa  236  8e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3816  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  33.41 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3584  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  33.26 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0397  long-chain fatty acid transport protein  35.1 
 
 
445 aa  233  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0475  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.39 
 
 
451 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0401  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.39 
 
 
449 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000690815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3757  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.1 
 
 
449 aa  229  8e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0902024 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0415  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.39 
 
 
449 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0390  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.39 
 
 
449 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0389  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.39 
 
 
449 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4546  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  34.16 
 
 
432 aa  227  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495383  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3824  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  34.32 
 
 
428 aa  223  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03125  hypothetical protein  32.72 
 
 
429 aa  219  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3468  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.4 
 
 
451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2270  outer membrane protein transport protein  33.63 
 
 
438 aa  215  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000125338  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0340  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.44 
 
 
450 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000312339  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002851  long-chain fatty acid transport protein  31.4 
 
 
442 aa  211  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0339  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.75 
 
 
452 aa  199  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000148311  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0560  long-chain fatty acid transport protein  30.98 
 
 
432 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00871251  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03834  Long-chain fatty acid transport protein  29.95 
 
 
464 aa  182  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000417169  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0350  aromatic hydrocarbon degradation protein  31.44 
 
 
401 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000805243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1655  aromatic hydrocarbon degradation protein  28.68 
 
 
423 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0166252  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1767  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.18 
 
 
424 aa  166  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0166103  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3669  aromatic hydrocarbon degradation protein  28.74 
 
 
427 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832534  normal  0.097076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1720  outer membrane protein  27.91 
 
 
424 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0182152  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4030  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.75 
 
 
426 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150189  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0893  outer membrane protein P1, putative  27.75 
 
 
422 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325084  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2706  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.38 
 
 
400 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.327378  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3059  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.46 
 
 
442 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292585  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1689  aromatic hydrocarbon degradation protein  28.11 
 
 
421 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918972  normal  0.897129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1287  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.65 
 
 
421 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102696  normal  0.683767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2482  aromatic hydrocarbon degradation protein  28.18 
 
 
423 aa  155  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1245  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.42 
 
 
421 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2013  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  30.3 
 
 
432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47540  putative outer membrane protein precursor  26.16 
 
 
424 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.638983 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3004  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.57 
 
 
450 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2658  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.96 
 
 
450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000308676  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4102  outer membrane protein  25.19 
 
 
429 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.630925  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2596  long chain fatty acid transport protein  28.61 
 
 
405 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0488563  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1313  aromatic hydrocarbon degradation protein  29.44 
 
 
429 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1548  aromatic hydrocarbon degradation protein  25.45 
 
 
442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000033121  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1551  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.71 
 
 
400 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0286516  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4441  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.85 
 
 
437 aa  123  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1758  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.68 
 
 
430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.407775  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60730  putative outer membrane protein  27.4 
 
 
463 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0539  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.45 
 
 
488 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5229  outer membrane protein  25.69 
 
 
482 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001387  long-chain fatty acid transport protein  28.1 
 
 
368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>