83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2146 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2146  putative MltA-interacting protein MipA  100 
 
 
250 aa  513  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0292974  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06020  hypothetical protein  40 
 
 
211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3466  MltA-interacting MipA family protein  30.16 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  31.05 
 
 
248 aa  128  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  30.71 
 
 
274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  30.45 
 
 
248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  30.71 
 
 
274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  30.45 
 
 
248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  30.45 
 
 
248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  29.6 
 
 
256 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  29.6 
 
 
273 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  29.6 
 
 
256 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  29.88 
 
 
248 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  29.88 
 
 
248 aa  123  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  29.88 
 
 
248 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  29.88 
 
 
248 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  29.88 
 
 
248 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  29.88 
 
 
248 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  29.88 
 
 
248 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  29.88 
 
 
248 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  29.46 
 
 
248 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  29.65 
 
 
250 aa  121  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0145  MltA-interacting MipA family protein  28.57 
 
 
246 aa  119  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  28.74 
 
 
249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  27.98 
 
 
249 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  26.21 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  26.91 
 
 
249 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  27.53 
 
 
249 aa  105  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  27.71 
 
 
246 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  27.71 
 
 
246 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  27.71 
 
 
246 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  27.71 
 
 
246 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  27.71 
 
 
246 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  27.27 
 
 
246 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  27.71 
 
 
246 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  27.71 
 
 
246 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0478  MltA-interacting MipA family protein  27.78 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  26.85 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  27.46 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1090  MltA-interacting MipA family protein  24.53 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  25.73 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  25.94 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  26.56 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  22.76 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  22.76 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  25.23 
 
 
491 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3592  hypothetical protein  23.13 
 
 
304 aa  62.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  25.82 
 
 
497 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3182  MltA-interacting MipA family protein  22.39 
 
 
304 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0446172  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1106  MltA-interacting MipA family protein  25.11 
 
 
304 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.374888  normal  0.0229825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1073  MltA-interacting MipA family protein  25.11 
 
 
287 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3285  MltA-interacting MipA family protein  25.11 
 
 
287 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011274  normal  0.15127 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  22.93 
 
 
311 aa  58.9  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  21.76 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  22.06 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1012  MltA-interacting MipA family protein  23.58 
 
 
288 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00934718  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  21.72 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1004  MltA-interacting MipA family protein  24.23 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2586  scaffolding protein for murein-synthesizing holoenzyme putative outermembrane protein  21.32 
 
 
245 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  23.33 
 
 
291 aa  52.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3566  MltA-interacting MipA family protein  24.06 
 
 
257 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119628  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0752  MltA-interacting MipA family protein  23.68 
 
 
257 aa  52  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0638189  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2535  hypothetical protein  23.02 
 
 
429 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0449668  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  23.68 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  23.68 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0152  hypothetical protein  20.57 
 
 
307 aa  49.3  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3404  MltA-interacting MipA  23.73 
 
 
282 aa  48.9  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  22.09 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3166  MltA-interacting MipA family protein  23.83 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0847  MltA-interacting MipA family protein  24.53 
 
 
257 aa  47  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0974591  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  23.66 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2450  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase HemN  21.11 
 
 
253 aa  45.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.846103  normal  0.839506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3867  MltA-interacting MipA family protein  25.81 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  24.8 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  23.79 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1626  MltA-interacting protein MipA  27.05 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.124985  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2798  putative outer membrane protein  22.05 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0453163  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  22.3 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3058  MltA-interacting MipA family protein  23.31 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_0683  hypothetical protein  23.65 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_0561  MltA-interacting MipA  25 
 
 
257 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.711283  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_3708  MltA-interacting MipA family protein  23.38 
 
 
256 aa  42.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003551  hypothetical protein  24.11 
 
 
445 aa  42.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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