More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2130 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2130  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 546 aa  1104    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665531  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  51.76 
 
 		 545 aa  501  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  50.83 
 
 		 545 aa  490  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.92 
 
 		 716 aa  264  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  39.82 
 
 		 713 aa  258  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.87 
 
 		 634 aa  252  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  43.48 
 
 		 553 aa  251  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  43.35 
 
 		 712 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.77 
 
 		 702 aa  250  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.650804  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  41.08 
 
 		 559 aa  250  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  42.11 
 
 		 712 aa  250  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.83 
 
 		 560 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.91 
 
 		 634 aa  247  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  43.48 
 
 		 553 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.71 
 
 		 638 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.64 
 
 		 552 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  43.34 
 
 		 634 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  40.75 
 
 		 626 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.98 
 
 		 674 aa  237  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.6 
 
 		 554 aa  237  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.3 
 
 		 543 aa  237  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.35 
 
 		 554 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.51 
 
 		 543 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0986947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.3 
 
 		 643 aa  236  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3382  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.51 
 
 		 543 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  41.79 
 
 		 629 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.89 
 
 		 564 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.51 
 
 		 543 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.073872  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3455  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.51 
 
 		 543 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121993  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0959  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.12 
 
 		 543 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656726  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.14 
 
 		 627 aa  234  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1951  methyl-accepting chemotaxis protein  44.06 
 
 		 720 aa  233  6e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.86 
 
 		 554 aa  233  6e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.6 
 
 		 554 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.51 
 
 		 637 aa  233  9e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3256  methyl-accepting chemotaxis protein  41.03 
 
 		 558 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  40.9 
 
 		 560 aa  233  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.81 
 
 		 645 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.6 
 
 		 554 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  40.36 
 
 		 561 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.75 
 
 		 645 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.14 
 
 		 548 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.32 
 
 		 543 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  40.36 
 
 		 561 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 		 554 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.77 
 
 		 568 aa  231  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  40.23 
 
 		 632 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  41.41 
 
 		 497 aa  231  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 		 554 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.44 
 
 		 645 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0923  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.51 
 
 		 543 aa  230  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.56 
 
 		 637 aa  230  6e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0081  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.36 
 
 		 544 aa  230  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  40.23 
 
 		 629 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  39.94 
 
 		 632 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.59 
 
 		 554 aa  229  9e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.35 
 
 		 554 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 		 554 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.59 
 
 		 554 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  41.35 
 
 		 554 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.3 
 
 		 554 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  41.21 
 
 		 629 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.99 
 
 		 558 aa  228  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.06 
 
 		 554 aa  227  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  39.53 
 
 		 554 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  40.86 
 
 		 714 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  39.94 
 
 		 629 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 		 629 aa  226  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  42.27 
 
 		 712 aa  226  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 		 645 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  40.61 
 
 		 629 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.33 
 
 		 628 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44 
 
 		 552 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.95 
 
 		 554 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.94 
 
 		 497 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.615607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.3 
 
 		 438 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  37.78 
 
 		 645 aa  225  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  32.45 
 
 		 545 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.33 
 
 		 628 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  40.29 
 
 		 714 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.3 
 
 		 554 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.96 
 
 		 625 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.41 
 
 		 555 aa  223  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  38.15 
 
 		 643 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.17 
 
 		 568 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  40.3 
 
 		 629 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 714 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.28 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.87 
 
 		 554 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  41.87 
 
 		 554 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.44 
 
 		 541 aa  220  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  38.76 
 
 		 564 aa  220  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.43 
 
 		 640 aa  220  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.77 
 
 		 543 aa  219  7e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.72 
 
 		 626 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0756  methyl-accepting chemotaxis protein  40.28 
 
 		 558 aa  219  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.82 
 
 		 636 aa  219  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  38.94 
 
 		 714 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.72 
 
 		 540 aa  218  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  40.67 
 
 		 623 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>