44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2085 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2085  heat shock protein  100 
 
 		 147 aa  304  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003792  heat shock protein HslJ  67.35 
 
 		 148 aa  207  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000159287  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02669  hypothetical protein  67.35 
 
 		 147 aa  203  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1268  heat shock protein HslJ  68.28 
 
 		 147 aa  202  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000183655  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2601  heat-inducible protein  34.9 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1917  heat-inducible protein  33.55 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2211  heat-inducible protein  33.55 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.27688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1807  heat-inducible protein  32.9 
 
 		 150 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2266  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.76 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221661  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01363  hypothetical protein  31.76 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1616  heat-inducible protein  31.76 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1773  heat-inducible protein  31.76 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2276  heat-inducible protein  31.76 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1466  heat-inducible protein  31.76 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01351  heat-inducible protein  31.76 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1563  heat-inducible protein  31.76 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2000  heat-inducible protein  31.76 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1765  heat-inducible protein  28.38 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0625871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0202  heat shock protein HslJ  37.74 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1508  heat-inducible protein  27.7 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1768  heat-inducible protein  27.7 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0151813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1691  heat-inducible protein  28.38 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.797199  hitchhiker  0.00277177 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1828  heat-inducible protein  28.38 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2134  heat-inducible protein  28.28 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.567559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  31.36 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.25 
 
 		 351 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.92 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0744  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.67 
 
 		 137 aa  48.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0867  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.03 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  28.06 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3278  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.85 
 
 		 280 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0776  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.06 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3930  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  25.85 
 
 		 274 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35 
 
 		 278 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  33.72 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1689  lipoprotein, putative  33.72 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.93 
 
 		 126 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0923  hypothetical protein  26.39 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2272  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.47 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0450921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.46 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  30.48 
 
 		 246 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3658  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.12 
 
 		 171 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0975  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.24 
 
 		 167 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0939  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.24 
 
 		 167 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104355  normal  0.45833 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>