More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2067 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03318  zinc, cobalt and lead efflux system  51.39 
 
 		 732 aa  683    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0246  heavy metal translocating P-type ATPase  51.66 
 
 		 732 aa  682    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3888  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  51.86 
 
 		 732 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1611  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  54.57 
 
 		 803 aa  780    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.730441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3948  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  52.13 
 
 		 732 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3853  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  51.26 
 
 		 732 aa  679    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004007  copper-translocating P-type ATPase  57.18 
 
 		 768 aa  853    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3778  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  51.99 
 
 		 732 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  50.21 
 
 		 712 aa  644    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03271  hypothetical protein  51.39 
 
 		 732 aa  683    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01515  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  61.25 
 
 		 689 aa  819    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0088  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  50.83 
 
 		 784 aa  697    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.473574  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2067  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  100 
 
 		 773 aa  1561    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0093  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  51.52 
 
 		 787 aa  693    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0247  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  51.33 
 
 		 732 aa  680    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0551  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  55.99 
 
 		 768 aa  819    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3951  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  51.53 
 
 		 732 aa  684    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0571  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  52.2 
 
 		 782 aa  683    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0233  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  51.93 
 
 		 788 aa  675    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3668  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  51.39 
 
 		 732 aa  682    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3985  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  52.33 
 
 		 782 aa  684    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4789  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  51.39 
 
 		 732 aa  683    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3845  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  51.86 
 
 		 732 aa  692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3873  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  53.9 
 
 		 728 aa  711    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472181  normal  0.24383 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3768  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  52.13 
 
 		 732 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0209  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  52.17 
 
 		 771 aa  751    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0277781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3752  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  51.53 
 
 		 732 aa  681    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  47.74 
 
 		 904 aa  626  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  48.51 
 
 		 711 aa  617  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  47.77 
 
 		 793 aa  617  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  45.53 
 
 		 738 aa  614  9.999999999999999e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  47.81 
 
 		 726 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2752  heavy metal translocating P-type ATPase  47.28 
 
 		 722 aa  603  1.0000000000000001e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  48.21 
 
 		 709 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  46.2 
 
 		 844 aa  595  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  45.15 
 
 		 734 aa  595  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  47.56 
 
 		 720 aa  592  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4071  heavy metal translocating P-type ATPase  47.83 
 
 		 712 aa  586  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.515155 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  45.57 
 
 		 734 aa  586  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4129  heavy metal translocating P-type ATPase  43.92 
 
 		 955 aa  587  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594841  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  43.07 
 
 		 740 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  43.23 
 
 		 740 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1096  heavy metal translocating P-type ATPase  45.93 
 
 		 731 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0212  heavy metal translocating P-type ATPase  43.71 
 
 		 758 aa  584  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  45.57 
 
 		 718 aa  582  1e-164  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2344  heavy metal translocating P-type ATPase  44.21 
 
 		 732 aa  576  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.442895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7259  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  51.45 
 
 		 678 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.482594 
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  46.18 
 
 		 814 aa  575  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4117  heavy metal translocating P-type ATPase  46.09 
 
 		 731 aa  571  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  45.51 
 
 		 704 aa  568  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5561  P type cation (metal) transporter ATPase component  43.38 
 
 		 757 aa  564  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.85793  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0269  heavy metal translocating P-type ATPase  46.72 
 
 		 713 aa  562  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1505  heavy metal translocating P-type ATPase  44.73 
 
 		 716 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3796  heavy metal translocating P-type ATPase  43.47 
 
 		 756 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  51.63 
 
 		 744 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  43.09 
 
 		 764 aa  552  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3501  heavy metal translocating P-type ATPase  49.03 
 
 		 758 aa  548  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.968413 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3411  hypothetical protein  43.19 
 
 		 803 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3467  heavy metal translocating P-type ATPase  49.43 
 
 		 634 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3978  heavy metal translocating P-type ATPase  43.18 
 
 		 759 aa  522  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39503  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3338  heavy metal translocating P-type ATPase  43.44 
 
 		 759 aa  525  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.837764  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1027  (Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  42.36 
 
 		 777 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  40.31 
 
 		 712 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  40.22 
 
 		 712 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  40.08 
 
 		 712 aa  505  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  40.14 
 
 		 707 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  39.35 
 
 		 709 aa  489  1e-137  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  39.18 
 
 		 734 aa  477  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 799 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  40.11 
 
 		 799 aa  463  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  37.87 
 
 		 833 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  39.37 
 
 		 800 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  40.37 
 
 		 735 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  39.37 
 
 		 800 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  38.36 
 
 		 738 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  38.44 
 
 		 750 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5947  Pb(II) resistance ATPase PbrA  40.54 
 
 		 799 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 		 734 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  35.1 
 
 		 783 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  38.56 
 
 		 800 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  38.95 
 
 		 939 aa  449  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 713 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  38.23 
 
 		 712 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  38.48 
 
 		 750 aa  446  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4594  ZntA, P-type ATPase involved in Zn(II), Cd(II), Tl(I) and Pb(II) resistance  36.7 
 
 		 794 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0280589  hitchhiker  0.0082213 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  38.65 
 
 		 801 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  38.19 
 
 		 750 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  38.19 
 
 		 750 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  38.98 
 
 		 726 aa  442  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  36.81 
 
 		 748 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  37.63 
 
 		 984 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  37.63 
 
 		 984 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  38.78 
 
 		 701 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2810  heavy metal translocating P-type ATPase  37.45 
 
 		 800 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  35.04 
 
 		 767 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  36.59 
 
 		 868 aa  435  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  40.89 
 
 		 737 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  38.16 
 
 		 791 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  43.03 
 
 		 750 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  35.97 
 
 		 769 aa  432  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>