99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2024 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  100 
 
 		 817 aa  1668    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  54.59 
 
 		 836 aa  899    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  56.3 
 
 		 817 aa  937    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  56.18 
 
 		 817 aa  949    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  30.22 
 
 		 889 aa  308  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  30.22 
 
 		 889 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  30.48 
 
 		 849 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  30.02 
 
 		 879 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  30.16 
 
 		 884 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  30.28 
 
 		 878 aa  301  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  30.18 
 
 		 887 aa  300  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  31.1 
 
 		 820 aa  298  4e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  30.36 
 
 		 887 aa  296  8e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  29.81 
 
 		 897 aa  296  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  28.05 
 
 		 836 aa  289  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  30.06 
 
 		 819 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  29.07 
 
 		 865 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  29.72 
 
 		 889 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  29.53 
 
 		 850 aa  282  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  27.89 
 
 		 836 aa  280  7e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  31.41 
 
 		 845 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  32.44 
 
 		 820 aa  274  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  29.06 
 
 		 840 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  29.37 
 
 		 821 aa  265  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  28.48 
 
 		 821 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  29.74 
 
 		 821 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  29.42 
 
 		 800 aa  259  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  28.55 
 
 		 800 aa  259  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  30.03 
 
 		 802 aa  249  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  29.87 
 
 		 804 aa  245  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  24.65 
 
 		 849 aa  222  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  26.39 
 
 		 850 aa  220  7.999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  25.93 
 
 		 803 aa  215  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  27.69 
 
 		 793 aa  207  9e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 		 847 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  23.69 
 
 		 855 aa  188  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  25.59 
 
 		 813 aa  188  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  26.91 
 
 		 866 aa  185  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  26.09 
 
 		 870 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  25.15 
 
 		 847 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  25.67 
 
 		 837 aa  181  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  25.15 
 
 		 839 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  33.51 
 
 		 820 aa  177  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  31.14 
 
 		 872 aa  150  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  33.63 
 
 		 815 aa  146  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  31.55 
 
 		 821 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  32.73 
 
 		 825 aa  138  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  31.45 
 
 		 819 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  25.84 
 
 		 843 aa  134  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  31.45 
 
 		 826 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  22.98 
 
 		 858 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  31.84 
 
 		 795 aa  127  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  29.75 
 
 		 819 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  29.66 
 
 		 819 aa  124  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  28.84 
 
 		 846 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  25.23 
 
 		 929 aa  113  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  31.84 
 
 		 795 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  27.18 
 
 		 843 aa  109  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  31.56 
 
 		 795 aa  107  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  24.86 
 
 		 842 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  25.32 
 
 		 842 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  25.45 
 
 		 753 aa  102  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  27.34 
 
 		 842 aa  95.9  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  21.31 
 
 		 855 aa  94  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  21.46 
 
 		 857 aa  90.9  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  26.69 
 
 		 841 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  23.16 
 
 		 857 aa  88.2  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  22.29 
 
 		 844 aa  88.2  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  21.59 
 
 		 858 aa  88.2  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  23.09 
 
 		 846 aa  87.8  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  21.62 
 
 		 851 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  23.78 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  29.24 
 
 		 845 aa  78.2  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  21.62 
 
 		 867 aa  77.4  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  21.05 
 
 		 884 aa  73.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  20.03 
 
 		 855 aa  72.4  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  21.48 
 
 		 868 aa  72  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  23.61 
 
 		 853 aa  63.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  21 
 
 		 877 aa  63.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  22.06 
 
 		 866 aa  62.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  22.56 
 
 		 852 aa  62.4  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  22.19 
 
 		 848 aa  58.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  20.1 
 
 		 850 aa  58.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  21.6 
 
 		 855 aa  57.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  22.11 
 
 		 847 aa  57.8  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  24.32 
 
 		 835 aa  56.6  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  24.32 
 
 		 835 aa  56.6  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  21.37 
 
 		 845 aa  56.6  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  22.22 
 
 		 877 aa  55.5  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  20.2 
 
 		 836 aa  54.3  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1090 aa  50.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  30.48 
 
 		 402 aa  48.9  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  20.13 
 
 		 849 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  21.07 
 
 		 861 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  27.21 
 
 		 413 aa  47  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 		 792 aa  47  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  31.08 
 
 		 827 aa  45.8  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  22.22 
 
 		 393 aa  44.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 930 aa  44.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>