98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2007 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2007  phosphatidylglycerophosphatase B  100 
 
 
253 aa  513  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06845  phosphatidylglycerophosphatase B  34.47 
 
 
241 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000870  membrane-associated phospholipid phosphatase  36.32 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0099  putative phosphatidylglycerophosphatase B  37.16 
 
 
274 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000115517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4335  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  34.34 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1917  phosphatidylglycerophosphatase B  33.33 
 
 
253 aa  91.7  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857525  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2232  phosphatidylglycerophosphatase B  33.33 
 
 
253 aa  91.7  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000384262  hitchhiker  0.00312553 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2028  phosphatidylglycerophosphatase B  33.33 
 
 
253 aa  91.7  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000921729  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0354  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.87 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0364  phosphatidylglycerophosphatase  31.86 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0369  phosphatidylglycerophosphatase  30.88 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3657  phosphatidylglycerophosphatase  30.88 
 
 
271 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  29.41 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2190  phosphatidylglycerophosphatase B  31.05 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128246  hitchhiker  0.0000491085 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2370  phosphatidylglycerophosphatase B  28.24 
 
 
258 aa  82  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2652  phosphatidylglycerophosphatase B  30.85 
 
 
257 aa  82  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000111048  unclonable  0.0000000410416 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0462  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.44 
 
 
257 aa  82  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3920  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.39 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4154  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.36 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3997  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.98 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1700  phosphatidylglycerophosphatase B  30.29 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000559502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4020  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.98 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1912  phosphatidylglycerophosphatase B  33.96 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000677496  unclonable  3.2959700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1620  phosphatidylglycerophosphatase B  29.41 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00558855  hitchhiker  1.12329e-19 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1439  phosphatidylglycerophosphatase B  29.41 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000437206  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2348  phosphatidylglycerophosphatase B  33.96 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000463864  unclonable  0.0000000183837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1480  phosphatidylglycerophosphatase B  33.96 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000040898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1851  phosphatidylglycerophosphatase B  33.96 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000018502  unclonable  4.59635e-21 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1389  phosphatidylglycerophosphatase B  33.96 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000467722  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1839  phosphatidylglycerophosphatase B  29.41 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.030955  hitchhiker  0.000257274 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1506  phosphatidylglycerophosphatase B  33.96 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148348  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1834  phosphatidylglycerophosphatase B  29.41 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.127293  hitchhiker  2.60377e-27 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1897  phosphatidylglycerophosphatase B  29.41 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00462631  hitchhiker  4.757070000000001e-18 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2369  Phosphatidylglycerophosphatase  33.96 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000909296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01255  phosphatidylglycerophosphatase B  33.96 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00156775  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01266  hypothetical protein  33.96 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00208867  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1042  phosphatidylglycerophosphatase  31.12 
 
 
245 aa  78.6  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4113  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.98 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3606  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.49 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1733  phosphatidylglycerophosphatase B  33.33 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00419578  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3275  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  31.75 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0302  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.94 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.5 
 
 
320 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.33 
 
 
241 aa  52.4  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0119  PA-phosphatase related phosphoesterase  42.47 
 
 
256 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00406131  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6892  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.36 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2570  hypothetical protein  33.71 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.36 
 
 
360 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3574  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.84 
 
 
267 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3250  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.84 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807425 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5915  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.11 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322864  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1755  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.16 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0828  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.19 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238614 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1672  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.25 
 
 
244 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.47 
 
 
252 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0231  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
238 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0824  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.96 
 
 
241 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2555  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.31 
 
 
271 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.729938  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1706  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.18 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2748  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  37.97 
 
 
248 aa  45.8  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.572696  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.54 
 
 
267 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2334  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.11 
 
 
242 aa  45.4  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254017 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.8 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4605  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.54 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
438 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.57 
 
 
272 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2342  PAP2 family protein  32.14 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2154  PAP2 family protein  32.14 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2092  phosphatidylglycerophosphatase B  32.14 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2088  phosphatidylglycerophosphatase B  32.14 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0563174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2309  PAP2 family protein  32.14 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2364  phosphatase, PAP2 family  22.84 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00067677  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0154  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.19 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2335  PAP2 family protein  32.14 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1125  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.96 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.223896  hitchhiker  0.00699955 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2990  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.78 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2178  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.51 
 
 
197 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.893732  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2905  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.78 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3095  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.78 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0315  membrane-associated phospholipid phosphatase  34.48 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.770739  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2290  PAP2 family protein  32.46 
 
 
138 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.94 
 
 
157 aa  43.5  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.16 
 
 
201 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0055  undecaprenyl-diphosphatase  32.18 
 
 
200 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.16 
 
 
201 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0282  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.23 
 
 
246 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0187484  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.67 
 
 
194 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  33.7 
 
 
438 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1443  PAP2 family protein  31.07 
 
 
214 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.253975  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.86 
 
 
169 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1205  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.13 
 
 
215 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2126  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.74 
 
 
213 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0807737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3032  PAP2 family protein  32.46 
 
 
213 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2417  PAP2 family protein  31.25 
 
 
213 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.1 
 
 
171 aa  42.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.06 
 
 
178 aa  42  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5319  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.82 
 
 
220 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2985  PAP2 superfamily protein  36.84 
 
 
175 aa  42  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>