More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1887 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  100 
 
 
173 aa  352  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  92.49 
 
 
173 aa  330  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  91.91 
 
 
173 aa  328  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  88.44 
 
 
173 aa  314  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.86785e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  69.36 
 
 
173 aa  242  1e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  71.68 
 
 
173 aa  233  1e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  5.71856e-08 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  71.68 
 
 
173 aa  233  1e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  71.68 
 
 
173 aa  233  1e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  8.85772e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  71.68 
 
 
173 aa  233  1e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.04743e-05  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  72.83 
 
 
173 aa  231  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  69.36 
 
 
173 aa  231  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  69.94 
 
 
173 aa  231  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  70.52 
 
 
173 aa  230  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  70.52 
 
 
173 aa  230  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  70.52 
 
 
173 aa  230  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  70.52 
 
 
173 aa  230  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0214105 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  70.52 
 
 
173 aa  230  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  71.68 
 
 
173 aa  229  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  69.36 
 
 
173 aa  228  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  69.36 
 
 
173 aa  228  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  69.36 
 
 
173 aa  228  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  69.36 
 
 
173 aa  228  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  69.36 
 
 
173 aa  228  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  68.21 
 
 
173 aa  229  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  69.36 
 
 
173 aa  228  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  69.36 
 
 
173 aa  228  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  69.36 
 
 
173 aa  228  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2157  Holliday junction resolvase  69.36 
 
 
173 aa  228  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  64.74 
 
 
173 aa  227  5e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  69.94 
 
 
173 aa  227  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1818  Holliday junction resolvase  68.79 
 
 
173 aa  227  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  68.79 
 
 
173 aa  226  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  68.79 
 
 
173 aa  226  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  68.79 
 
 
173 aa  226  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  69.94 
 
 
173 aa  225  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2102  Holliday junction resolvase  68.79 
 
 
173 aa  224  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  69.36 
 
 
173 aa  222  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.00533e-05  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  69.36 
 
 
173 aa  222  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  69.36 
 
 
173 aa  221  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  68.21 
 
 
173 aa  220  6e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  68.79 
 
 
173 aa  220  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  66.47 
 
 
173 aa  218  4e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  68.79 
 
 
173 aa  216  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  63.54 
 
 
189 aa  214  6e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2946  Holliday junction resolvase  65.9 
 
 
173 aa  213  1e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185202  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1841  Holliday junction resolvase  69.94 
 
 
173 aa  211  4e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.291427 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  65.14 
 
 
175 aa  204  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  60 
 
 
174 aa  201  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1706  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.38 
 
 
175 aa  196  2e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0826466  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  56.22 
 
 
194 aa  192  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  56.9 
 
 
175 aa  191  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  54.91 
 
 
174 aa  190  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  56.96 
 
 
174 aa  188  3e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  56.96 
 
 
174 aa  187  6e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.86306e-05 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  59.87 
 
 
164 aa  185  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  59.87 
 
 
164 aa  184  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.74044e-15 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0314  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  55.49 
 
 
173 aa  184  4e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.290454  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  53.8 
 
 
194 aa  184  7e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.29 
 
 
176 aa  183  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  53.8 
 
 
194 aa  183  1e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2535  Holliday junction resolvase  59.3 
 
 
173 aa  180  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.278528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  54.17 
 
 
183 aa  177  5e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.14 
 
 
165 aa  176  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1244  Holliday junction resolvase  59.49 
 
 
174 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61539  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1215  Holliday junction resolvase  59.49 
 
 
174 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0458654  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4203  Holliday junction resolvase  59.49 
 
 
174 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0438295  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  52.27 
 
 
181 aa  174  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  56.95 
 
 
164 aa  174  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  56.95 
 
 
164 aa  174  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  51.46 
 
 
176 aa  172  2e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  55.92 
 
 
171 aa  172  2e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.23238e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4000  Holliday junction resolvase  58.86 
 
 
174 aa  172  2e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36710  Holliday junction resolvase  58.23 
 
 
174 aa  172  2e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  53.41 
 
 
181 aa  172  2e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  50.57 
 
 
181 aa  171  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  50 
 
 
181 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3409  Holliday junction resolvase  50.29 
 
 
182 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.102403  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  50.57 
 
 
181 aa  169  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2188  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.94 
 
 
185 aa  166  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240809  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  50.29 
 
 
180 aa  163  1e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1250  Holliday junction resolvase  52.3 
 
 
174 aa  162  1e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  55.83 
 
 
174 aa  163  1e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  52 
 
 
180 aa  162  2e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  50.29 
 
 
180 aa  162  2e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1846  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  61.76 
 
 
186 aa  162  2e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.018832  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  52 
 
 
180 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  52 
 
 
180 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1250  Holliday junction resolvase  52.3 
 
 
174 aa  162  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  52 
 
 
180 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  52 
 
 
180 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  52 
 
 
275 aa  161  5e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  52 
 
 
284 aa  161  5e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  50.29 
 
 
180 aa  160  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0941  Holliday junction resolvase  55.7 
 
 
204 aa  159  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1060  Holliday junction resolvase  55.7 
 
 
181 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01729  Holliday junction resolvase  59.71 
 
 
146 aa  160  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  1.2224e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  50 
 
 
183 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  51.43 
 
 
180 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  49.14 
 
 
182 aa  157  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  52.23 
 
 
183 aa  157  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>