More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1850 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1850  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 
134 aa  283  7e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  67.94 
 
 
136 aa  199  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  71.07 
 
 
166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1584  methionine sulfoxide reductase B  73.17 
 
 
147 aa  196  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000628294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2262  methionine sulfoxide reductase B  64.35 
 
 
139 aa  169  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00190122  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1966  methionine sulfoxide reductase B  63.48 
 
 
139 aa  168  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0169175  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2214  methionine-R-sulfoxide reductase  65.22 
 
 
138 aa  166  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.399657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1863  methionine sulfoxide reductase B  62.18 
 
 
137 aa  164  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000150257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1854  methionine sulfoxide reductase B  62.18 
 
 
137 aa  164  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0487085  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01747  methionine sulfoxide reductase B  61.34 
 
 
137 aa  163  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0193587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1864  methionine-R-sulfoxide reductase  61.34 
 
 
137 aa  163  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000480706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01735  hypothetical protein  61.34 
 
 
137 aa  163  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  61.34 
 
 
137 aa  163  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  61.34 
 
 
137 aa  163  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  61.34 
 
 
137 aa  163  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1884  methionine sulfoxide reductase B  58.68 
 
 
137 aa  160  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000227022  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  59.66 
 
 
137 aa  160  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2065  methionine sulfoxide reductase B  59.66 
 
 
137 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.717826  hitchhiker  0.00120288 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1402  methionine sulfoxide reductase B  59.66 
 
 
137 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.0051199 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1385  methionine sulfoxide reductase B  59.66 
 
 
137 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0497198  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1972  methionine-R-sulfoxide reductase  60.33 
 
 
156 aa  159  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1418  methionine sulfoxide reductase B  59.66 
 
 
137 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.445758 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2727  methionine sulfoxide reductase B  59.5 
 
 
137 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00340114  hitchhiker  0.000973633 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1986  methionine sulfoxide reductase B  61.4 
 
 
137 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000131447  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  55.74 
 
 
127 aa  158  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2350  methionine sulfoxide reductase B  61.4 
 
 
137 aa  159  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167897  normal  0.0377518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2095  methionine sulfoxide reductase B  61.4 
 
 
137 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000449437  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  54.4 
 
 
142 aa  154  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  54.92 
 
 
131 aa  153  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  54.47 
 
 
131 aa  154  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  53.28 
 
 
148 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  52.42 
 
 
137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  53.28 
 
 
135 aa  150  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  53.78 
 
 
132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  51.26 
 
 
142 aa  150  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  55 
 
 
135 aa  150  8e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  52.38 
 
 
133 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  53.78 
 
 
132 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  50.81 
 
 
131 aa  149  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  50.81 
 
 
131 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  48.51 
 
 
135 aa  147  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  54.55 
 
 
131 aa  147  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  56.2 
 
 
133 aa  147  6e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  52.42 
 
 
134 aa  147  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  53.28 
 
 
142 aa  146  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  54.1 
 
 
177 aa  146  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  55.46 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3401  methionine sulfoxide reductase B  57.52 
 
 
141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  48.85 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  53.78 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  49.19 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  51.61 
 
 
134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 
133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  51.64 
 
 
134 aa  145  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  52.8 
 
 
133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  51.16 
 
 
134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  53.28 
 
 
133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 
133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  52.85 
 
 
131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  52.46 
 
 
144 aa  144  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  49.58 
 
 
139 aa  144  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  53.72 
 
 
132 aa  144  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  52.94 
 
 
163 aa  143  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  48.85 
 
 
138 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  51.67 
 
 
133 aa  143  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  53.72 
 
 
130 aa  143  8.000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  50.81 
 
 
132 aa  143  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  48.76 
 
 
128 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  52.89 
 
 
140 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  52.46 
 
 
135 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  46.21 
 
 
134 aa  141  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2329  methionine sulfoxide reductase B  49.59 
 
 
142 aa  140  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  51.24 
 
 
183 aa  140  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2342  methionine-R-sulfoxide reductase  55.83 
 
 
125 aa  140  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929654  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  48.78 
 
 
140 aa  140  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  49.59 
 
 
140 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  50.81 
 
 
136 aa  140  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  49.19 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  50.41 
 
 
135 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  46.21 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2945  methionine-R-sulfoxide reductase  49.28 
 
 
141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  53.72 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  50.41 
 
 
136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  49.18 
 
 
136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  48.36 
 
 
133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2558  methionine-R-sulfoxide reductase  49.28 
 
 
141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0971304  normal  0.867883 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  47.76 
 
 
146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03070  methionine sulfoxide reductase B  58.41 
 
 
154 aa  138  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  47.93 
 
 
142 aa  138  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  47.93 
 
 
128 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  48.76 
 
 
136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  47.93 
 
 
128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  47.11 
 
 
141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  49.19 
 
 
159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0440  methionine sulfoxide reductase B  54.92 
 
 
155 aa  137  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  47.15 
 
 
140 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  53.72 
 
 
161 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2964  methionine sulfoxide reductase B  51.24 
 
 
156 aa  137  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>