131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1774 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  100 
 
 		 390 aa  761    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  53.35 
 
 		 400 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  52.94 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  52.42 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  55.15 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  52.3 
 
 		 395 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  51.65 
 
 		 395 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  52.04 
 
 		 395 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  51.66 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  52.32 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  52.69 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  51.92 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  51.92 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  51.92 
 
 		 395 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  51.47 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  51.41 
 
 		 361 aa  351  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  45.71 
 
 		 422 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  47.45 
 
 		 402 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  47.45 
 
 		 402 aa  344  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  47.45 
 
 		 402 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  45.71 
 
 		 422 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  45.71 
 
 		 422 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  45.71 
 
 		 422 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  45.71 
 
 		 422 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  45.23 
 
 		 403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  45.23 
 
 		 403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  45.23 
 
 		 403 aa  339  5e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  44.97 
 
 		 403 aa  338  8e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  44.97 
 
 		 403 aa  338  8e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  44.97 
 
 		 403 aa  338  8e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  44.97 
 
 		 403 aa  338  8e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  44.97 
 
 		 403 aa  338  8e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  44.97 
 
 		 403 aa  338  9e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  50.42 
 
 		 402 aa  322  9.000000000000001e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  49.26 
 
 		 402 aa  315  6e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  45.57 
 
 		 402 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  44.05 
 
 		 425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  43.44 
 
 		 403 aa  266  5e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3389  aromatic amino acid permease  41.41 
 
 		 395 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  38.04 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  41.37 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  40.05 
 
 		 392 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1074  tyrosine-specific transport protein, putative  43.43 
 
 		 395 aa  259  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0897  aromatic amino acid permease  41.58 
 
 		 391 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  40.54 
 
 		 400 aa  258  9e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1166  tyrosine-specific transport protein  44.13 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  40.82 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3465  aromatic amino acid permease  41.07 
 
 		 391 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230898  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0948  aromatic amino acid permease  42.86 
 
 		 391 aa  255  8e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0522769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0912  aromatic amino acid permease  42.86 
 
 		 391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.231999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3026  aromatic amino acid permease  42.6 
 
 		 391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  39.42 
 
 		 399 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0916  aromatic amino acid permease  42.93 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2939  tyrosine-specific transport protein, putative  41.41 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0683  aromatic amino acid permease  40.05 
 
 		 399 aa  239  5e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.205009  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  34.29 
 
 		 388 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06320  hypothetical protein  36 
 
 		 385 aa  199  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  31.17 
 
 		 425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  32.43 
 
 		 416 aa  197  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001420  tyrosine-specific transport protein  36.8 
 
 		 385 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  31.59 
 
 		 417 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  31.73 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  33.95 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  31.67 
 
 		 418 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  33.68 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  30.61 
 
 		 418 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  31.04 
 
 		 418 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  31.89 
 
 		 418 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  31.04 
 
 		 418 aa  189  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  31.89 
 
 		 418 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0710  hypothetical protein  32.45 
 
 		 396 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0692  hypothetical protein  32.45 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  31.04 
 
 		 418 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  31.89 
 
 		 418 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  31.89 
 
 		 418 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  31.97 
 
 		 414 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  33.68 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1337  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  36.09 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  30.67 
 
 		 418 aa  184  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  30.83 
 
 		 424 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  30.64 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  31.22 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  29.9 
 
 		 418 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  31.89 
 
 		 418 aa  176  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0691  hypothetical protein  34.07 
 
 		 398 aa  176  6e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0709  hypothetical protein  33.79 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  30.34 
 
 		 467 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  28.89 
 
 		 417 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  29.72 
 
 		 424 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  29.03 
 
 		 418 aa  169  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  29.35 
 
 		 409 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1723  tryptophan/tyrosine permease family protein  32.1 
 
 		 424 aa  163  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0448  tyrosine-specific transport protein  32.1 
 
 		 426 aa  163  6e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5140  tryptophan permease TnaB  32.27 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.406172 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03593  tryptophan transporter of low affinity  32.1 
 
 		 415 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03537  hypothetical protein  32.1 
 
 		 415 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3923  tryptophan permease TnaB  32.1 
 
 		 415 aa  155  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4218  tryptophan permease TnaB  32.1 
 
 		 415 aa  155  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4258  aromatic amino acid transporter  31.77 
 
 		 415 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4285  tryptophan permease TnaB  31.53 
 
 		 415 aa  153  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>