80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1753 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1753  TonB system transport protein ExbD1  100 
 
 		 141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00438106  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05242  biopolymer transport protein  55.07 
 
 		 137 aa  150  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001353  biopolymer transport protein ExbD1  53.68 
 
 		 137 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0325  TonB system transport protein ExbD1  54.23 
 
 		 138 aa  148  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000982985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.9 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.756364 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.07 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.65 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3672  TonB system transport protein ExbD1  42.96 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0787  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.15 
 
 		 139 aa  103  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425493  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0949  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.85 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.543665  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3341  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.85 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00402112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1051  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.85 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1018  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.62 
 
 		 145 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198442  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0963  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.62 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.48 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_002950  PG0632  biopolymer transport protein ExbD, putative  26.5 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.362389 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2919  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.83 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0661927  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  23.58 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  19.01 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  20 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  20 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  21.74 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.6 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.2 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.88 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.02 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  29.09 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  23.4 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  28.35 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  22.9 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  24.79 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.74 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.39 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4892  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.32 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  23.31 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  23.73 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2485  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.3 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000540401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.08 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  23.73 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2091  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.03 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0833564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0590  hypothetical protein  31.25 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  28.83 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  21.14 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3232  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.49 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2106  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.16 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  21.62 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.53 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  20.69 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  33.91 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.62 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975721 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.48 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.3 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  27.27 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1003  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.6 
 
 		 176 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5124  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.97 
 
 		 141 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0054  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.44 
 
 		 129 aa  42  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01562  protein TolR  23.45 
 
 		 149 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.97 
 
 		 134 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.43 
 
 		 148 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0572  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  41.2  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.6 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.67 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.21 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  21.74 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.42 
 
 		 150 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.73 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  25.42 
 
 		 150 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  21.62 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  25.42 
 
 		 150 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 152 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2499  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.63 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  19.15 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.7 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000374903  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.32 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.44 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.14 
 
 		 142 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.08 
 
 		 136 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.47 
 
 		 134 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>