More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1701 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  100 
 
 		 355 aa  736    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  35.45 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 		 356 aa  180  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  31.39 
 
 		 342 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  29.28 
 
 		 369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  30.82 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  35.31 
 
 		 331 aa  142  9e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  33.64 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  33.63 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  33.64 
 
 		 369 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  33.63 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  33.03 
 
 		 350 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  31.12 
 
 		 357 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  31.12 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  33.13 
 
 		 371 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  31.25 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  31.12 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  33.03 
 
 		 358 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  32.41 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  32.41 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  32.41 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  32.41 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  32.41 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  32.41 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  32.41 
 
 		 365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  32.05 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  30.19 
 
 		 326 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  32.14 
 
 		 321 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  31.35 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  30.87 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  32.36 
 
 		 318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  31.93 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  29.71 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  31.79 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  31.29 
 
 		 361 aa  123  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  29.38 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  30.23 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  25.9 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  45 
 
 		 239 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  40.16 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  30.1 
 
 		 376 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  42.5 
 
 		 240 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  45 
 
 		 239 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  44.34 
 
 		 219 aa  98.6  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  42.02 
 
 		 242 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  44 
 
 		 264 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 218 aa  97.8  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 244 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 		 218 aa  97.8  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  47.06 
 
 		 218 aa  96.7  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 210 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 		 219 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  43.4 
 
 		 214 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  48.51 
 
 		 230 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  25.44 
 
 		 355 aa  93.2  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  44.12 
 
 		 231 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  41.51 
 
 		 212 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  43.4 
 
 		 219 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  43.43 
 
 		 226 aa  90.5  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  43.62 
 
 		 217 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  48.48 
 
 		 210 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  48.48 
 
 		 210 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  47.01 
 
 		 429 aa  89.7  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 243 aa  90.1  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  43 
 
 		 212 aa  89.7  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  44 
 
 		 209 aa  89.7  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 228 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  44.44 
 
 		 225 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  45.65 
 
 		 241 aa  89.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  41.44 
 
 		 228 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  44 
 
 		 209 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 228 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  43.14 
 
 		 607 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  45 
 
 		 217 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  42 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  45 
 
 		 217 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  43 
 
 		 209 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 		 459 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  43.69 
 
 		 227 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 		 215 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  45.36 
 
 		 415 aa  87  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  38.66 
 
 		 223 aa  87  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  47 
 
 		 233 aa  87  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  37.7 
 
 		 352 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  47.5 
 
 		 223 aa  86.3  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  41.53 
 
 		 229 aa  86.3  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  44 
 
 		 230 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  49.47 
 
 		 229 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 222 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  45.88 
 
 		 656 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  25.53 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  37.42 
 
 		 238 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 		 230 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  45.65 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  48.65 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  48.86 
 
 		 215 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  42.11 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  44 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  46 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>