248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1587 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  100 
 
 
406 aa  799  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  57.86 
 
 
419 aa  463  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.62905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  55.95 
 
 
419 aa  459  1e-128  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.83947e-06  hitchhiker  4.93259e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  55.45 
 
 
420 aa  461  1e-128  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.84803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  57.04 
 
 
419 aa  455  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  4.73709e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  57.14 
 
 
419 aa  455  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.93425e-05  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  55.13 
 
 
420 aa  452  1e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  58.96 
 
 
405 aa  453  1e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  56.63 
 
 
419 aa  452  1e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  56.09 
 
 
419 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.65727e-08  hitchhiker  5.17288e-10 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  56.32 
 
 
419 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  8.52943e-08  unclonable  1.04739e-10 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  55.85 
 
 
419 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.01153e-05  unclonable  2.54337e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  56.59 
 
 
419 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.31174e-08  unclonable  5.78399e-12 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  58.46 
 
 
399 aa  450  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  56.68 
 
 
402 aa  447  1e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  58.96 
 
 
401 aa  447  1e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  55.13 
 
 
419 aa  447  1e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  9.7854e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  54.52 
 
 
420 aa  448  1e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.39256e-10  n/a   
 
 
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  56.44 
 
 
402 aa  445  1e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  56.68 
 
 
402 aa  447  1e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  56.68 
 
 
402 aa  447  1e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  55.37 
 
 
419 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  5.46598e-08  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  55.85 
 
 
419 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.90778e-07  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  55.85 
 
 
419 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.94256e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  54.4 
 
 
432 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  55.42 
 
 
402 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  55.4 
 
 
427 aa  444  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  56.44 
 
 
401 aa  443  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  54.32 
 
 
403 aa  439  1e-122  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  55.32 
 
 
427 aa  439  1e-122  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  3.61858e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  55.32 
 
 
427 aa  439  1e-122  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  54.68 
 
 
404 aa  441  1e-122  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  55.61 
 
 
419 aa  439  1e-122  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.98644e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  54.07 
 
 
402 aa  441  1e-122  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  52.25 
 
 
422 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  56.08 
 
 
402 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  54.88 
 
 
414 aa  434  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  53.58 
 
 
402 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.13486e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  52.66 
 
 
417 aa  433  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  56.22 
 
 
418 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.24283e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  51.23 
 
 
406 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  54.57 
 
 
402 aa  423  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  50 
 
 
422 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  54.73 
 
 
403 aa  423  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  54.93 
 
 
425 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  54.92 
 
 
414 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  52.96 
 
 
422 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  54.32 
 
 
408 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  58.45 
 
 
371 aa  415  1e-115  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  56.77 
 
 
423 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  56.77 
 
 
423 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  56.77 
 
 
423 aa  411  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  54.93 
 
 
425 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3885  Na+ dependent nucleoside transporter  55.56 
 
 
408 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  4.12566e-06 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  53.99 
 
 
425 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  51.79 
 
 
408 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4296  NupC family protein  51.12 
 
 
401 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  48.93 
 
 
425 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  47.98 
 
 
425 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3487  Na+ dependent nucleoside transporter  50.9 
 
 
401 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  49.28 
 
 
420 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  47.14 
 
 
418 aa  362  6e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3405  Na+ dependent nucleoside transporter  46.99 
 
 
415 aa  362  8e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  47.33 
 
 
417 aa  361  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  45.91 
 
 
419 aa  359  6e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  45.37 
 
 
408 aa  354  1e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  45.43 
 
 
424 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  45.43 
 
 
424 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  45.43 
 
 
424 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  45.37 
 
 
408 aa  352  7e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  45.43 
 
 
424 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  44.96 
 
 
426 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  46.42 
 
 
403 aa  351  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.45183e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  44.44 
 
 
424 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  46.29 
 
 
403 aa  350  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  2.31054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  45.2 
 
 
566 aa  349  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  45.2 
 
 
424 aa  348  8e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  45.93 
 
 
403 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.34447e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  45.93 
 
 
403 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.23055e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1497  nucleoside transporter  43.75 
 
 
416 aa  342  7e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.93356e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3297  nucleoside transporter, NupC family  43.75 
 
 
416 aa  342  9e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2297  NupC family nucleoside transporter  43.75 
 
 
416 aa  340  3e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  44.31 
 
 
413 aa  338  9e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2458  NupC family nucleoside transporter  43.51 
 
 
416 aa  338  1e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  45.15 
 
 
424 aa  338  1e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  45.15 
 
 
424 aa  338  1e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  45.15 
 
 
424 aa  337  2e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2308  NupC family nucleoside transporter  43.27 
 
 
416 aa  337  3e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  hitchhiker  0.000933793 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0805  nucleoside transporter, NupC family  43.99 
 
 
415 aa  336  5e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02049  hypothetical protein  43.27 
 
 
416 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02090  predicted nucleoside transporter  43.27 
 
 
416 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  43.3 
 
 
416 aa  332  6e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.02 
 
 
416 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  45.02 
 
 
416 aa  332  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5475  NupC family nucleoside transporter  45.19 
 
 
403 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  8.07855e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  45.19 
 
 
403 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  5.1013e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  45.19 
 
 
403 aa  330  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  45.19 
 
 
403 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.39018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  45.19 
 
 
403 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  45.19 
 
 
403 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  5.01622e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>