48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1471 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1471  putative antibiotic resistance protein  100 
 
 		 262 aa  549  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.292447  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04894  hypothetical protein  53.67 
 
 		 261 aa  294  9e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000753  hypothetical protein  55.04 
 
 		 257 aa  291  9e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5377  aminoglycoside phosphotransferase  43.02 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.556886  normal  0.652804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4227  aminoglycoside phosphotransferase  41.25 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.722733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2326  aminoglycoside phosphotransferase  43.5 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4777  aminoglycoside phosphotransferase  38.91 
 
 		 281 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1031  trifolitoxin immunity protein  38.31 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1183  trifolitoxin immunity protein  38.31 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00210871  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1028  trifolitoxin immunity protein  37.93 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3328  aminoglycoside phosphotransferase  40.23 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1288  trifolitoxin immunity domain protein  38.08 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000214818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1186  aminoglycoside phosphotransferase  36.76 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4156  trifolitoxin immunity protein  38.46 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000289256  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1053  trifolitoxin immunity domain-containing protein  37.16 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000137711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1230  trifolitoxin immunity domain-containing protein  37.16 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000170799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1133  trifolitoxin immunity domain-containing protein  37.16 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000583619  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1296  aminoglycoside phosphotransferase  37.3 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2126  aminoglycoside phosphotransferase  35.1 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.171035  normal  0.0430024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6530  aminoglycoside phosphotransferase  36.14 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0352215  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0761  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1068  aminoglycoside phosphotransferase  39.63 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2798  aminoglycoside phosphotransferase  36.82 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5213  putative aminoglycoside phosphotransferase protein (antibiotic resistance protein)  33.33 
 
 		 279 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0822  hypothetical protein  36.45 
 
 		 219 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740155  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3172  aminoglycoside phosphotransferase  41.46 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0232436  hitchhiker  0.0000000099783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7402  hypothetical protein  34.78 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1734  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3956  aminoglycoside phosphotransferase  29.8 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2954  aminoglycoside phosphotransferase  29.63 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00316699  decreased coverage  0.00012693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0079  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1212  trifolitoxin immunity protein  42.75 
 
 		 140 aa  99  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2040  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1013  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 279 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5537  aminoglycoside phosphotransferase  27.45 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72204  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2966  aminoglycoside phosphotransferase  26.46 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1421  putative trifolitoxin immunity protein  27.52 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2772  aminoglycoside phosphotransferase  28.92 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14970  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  26.85 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.448489  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35590  phosphotransferase family protein  26.41 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.886492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2262  aminoglycoside phosphotransferase  27.52 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.657806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1984  putative TfxG-like immunity protein against TfxA-like peptides  27.42 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1395  putative trifolitoxin immunity protein  30.26 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.815075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3867  aminoglycoside phosphotransferase  24.29 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499671  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0433  aminoglycoside phosphotransferase  48 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13550  aminoglycoside phosphotransferase  44.74 
 
 		 312 aa  42  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.669259  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5845  aminoglycoside phosphotransferase  32.61 
 
 		 345 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>