43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1189 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1189  putative branched-chain amino acid transport protein  100 
 
 		 106 aa  204  4e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06281  hypothetical protein  78.43 
 
 		 103 aa  142  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001439  hypothetical protein  71.57 
 
 		 103 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0234  hypothetical protein  71.29 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2539  branched-chain amino acid transport  54 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2529  branched-chain amino acid transport  56 
 
 		 100 aa  110  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2596  branched-chain amino acid transport  56 
 
 		 100 aa  110  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2695  branched-chain amino acid transport  56 
 
 		 100 aa  110  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1759  hypothetical protein  55 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1597  branched-chain amino acid transport  55 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2783  branched-chain amino acid transport  55 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  0.341399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1560  branched-chain amino acid transport  55 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1566  branched-chain amino acid transport  55 
 
 		 100 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1458  branched-chain amino acid transport  56 
 
 		 100 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3140  branched-chain amino acid transport  60 
 
 		 100 aa  103  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3236  branched-chain amino acid transport  57.58 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0069593  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1896  branched-chain amino acid transport  48.54 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1990  branched-chain amino acid transport  47.96 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2384  branched chain amino acid ABC transporter  47.96 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.316334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3311  branched-chain amino acid transport  46.94 
 
 		 104 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993943  normal  0.35173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3298  hypothetical protein  44.66 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38170  hypothetical protein  38.83 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00099917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3249  hypothetical protein  40.21 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131531  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2853  hypothetical protein  38 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.438366  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3799  branched-chain amino acid transport  35.48 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1355  branched-chain amino acid transport  41.3 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3611  branched-chain amino acid transport  35.48 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.480929  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2444  hypothetical protein  40.43 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  37.63 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4072  integrase family protein  34.78 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  31.58 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  31.87 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  31.31 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  32.67 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  32.67 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  39.19 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  41.27 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  41.27 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  42.37 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  35.96 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  24.74 
 
 		 107 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  31.52 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  35.94 
 
 		 95 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>