More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1187 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  100 
 
 		 278 aa  577  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  68.66 
 
 		 275 aa  408  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  68.71 
 
 		 277 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  67.54 
 
 		 275 aa  403  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 279 aa  359  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  60.74 
 
 		 278 aa  353  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  60.74 
 
 		 278 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  60 
 
 		 278 aa  349  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  60 
 
 		 278 aa  349  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  60.37 
 
 		 271 aa  348  6e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 278 aa  344  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  57.78 
 
 		 278 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  57.78 
 
 		 278 aa  337  9e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  57.78 
 
 		 278 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 312 aa  330  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  50.75 
 
 		 277 aa  288  8e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  49.63 
 
 		 280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 274 aa  248  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 278 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3613  transcriptional regulator, AraC family  42.91 
 
 		 278 aa  238  8e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.522508  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  39.78 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 278 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 279 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  35.83 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 276 aa  168  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 275 aa  165  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 300 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 300 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 276 aa  161  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  32.86 
 
 		 355 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  35.83 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  35.83 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 276 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  31.62 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  30.15 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  31.44 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1791  transcriptional regulator, AraC family  31.97 
 
 		 277 aa  136  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2317  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  32.82 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  28.83 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1551  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0639275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  31.3 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  32.3 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 300 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 288 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 266 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0279  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431722  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1460  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  27.48 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  30.04 
 
 		 281 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2811  transcriptional regulator, AraC family  30.92 
 
 		 303 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 276 aa  125  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2449  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 284 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1657  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441347  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  29.89 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0886  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 316 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0312  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00105398  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2585  AraC family transcription regulator  28.62 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  28.01 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5531  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0040  transcriptional regulator, AraC family  30.35 
 
 		 268 aa  123  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451948  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>