150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1181 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1181  putative type VI secretion protein VasE-1  100 
 
 		 438 aa  905    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100124  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  29.27 
 
 		 445 aa  196  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  28.86 
 
 		 446 aa  186  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  27.64 
 
 		 443 aa  183  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  26.7 
 
 		 442 aa  176  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  28.64 
 
 		 444 aa  173  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  27.13 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  27.47 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  27.62 
 
 		 445 aa  166  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  27.35 
 
 		 444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  27.62 
 
 		 445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  27.46 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  27.11 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  27.11 
 
 		 454 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  27.11 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  27.11 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  27.11 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  27.11 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  26.9 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.17 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  25.78 
 
 		 445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  24.83 
 
 		 445 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  25.97 
 
 		 468 aa  154  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  26.05 
 
 		 443 aa  153  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  27.13 
 
 		 444 aa  152  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  26.23 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  25.72 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  29.8 
 
 		 448 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  26.23 
 
 		 444 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  24.55 
 
 		 441 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  26.27 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  26.05 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  26.77 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.5 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  25.55 
 
 		 443 aa  147  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  26.93 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  26.93 
 
 		 443 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  24.32 
 
 		 441 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  24.33 
 
 		 448 aa  143  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  24.11 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  24.61 
 
 		 447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  24.11 
 
 		 480 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  24.11 
 
 		 449 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  24.11 
 
 		 452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  25.67 
 
 		 448 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  24.28 
 
 		 444 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  27.54 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  25.66 
 
 		 445 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  24.83 
 
 		 449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  24.83 
 
 		 449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  24.83 
 
 		 449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  22.75 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  22.75 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  25.44 
 
 		 445 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  24.1 
 
 		 445 aa  136  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  25.17 
 
 		 448 aa  136  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  25.17 
 
 		 448 aa  136  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3024  type VI secretion protein  23.21 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  22.75 
 
 		 443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  24.1 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  23.65 
 
 		 458 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  23.99 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  23.87 
 
 		 443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  23.87 
 
 		 443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  24.61 
 
 		 448 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  26.52 
 
 		 446 aa  133  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6677  type VI secretion protein  23.09 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  24.32 
 
 		 445 aa  131  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  23.66 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  23.66 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  23.66 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2188  hypothetical protein  23.66 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  23.1 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  23.44 
 
 		 448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0329  hypothetical protein  23.44 
 
 		 448 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  23.44 
 
 		 448 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  24.6 
 
 		 445 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2552  hypothetical protein  25.17 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0100062  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  23.04 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  22.82 
 
 		 447 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  22.82 
 
 		 447 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  22.82 
 
 		 447 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3913  type VI secretion protein  22.6 
 
 		 416 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  25.11 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2642  hypothetical protein  24.43 
 
 		 448 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0464  hypothetical protein  24.43 
 
 		 448 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0442  type VI secretion protein  24.43 
 
 		 448 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.429573 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  23.43 
 
 		 444 aa  99.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0024  hypothetical protein  26.79 
 
 		 301 aa  99.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.668164  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3556  hypothetical protein  24.2 
 
 		 448 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0420358  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  23.88 
 
 		 448 aa  97.8  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0378  hypothetical protein  24.2 
 
 		 448 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.493285  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0399  type VI secretion protein  24.2 
 
 		 448 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1887  hypothetical protein  24.57 
 
 		 453 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  23.72 
 
 		 448 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3552  type VI secretion protein  27.48 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0196523  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3423  hypothetical protein  27.48 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2088  hypothetical protein  24.57 
 
 		 453 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0852077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0803  hypothetical protein  24.57 
 
 		 453 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0715  hypothetical protein  24.57 
 
 		 453 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.147759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>