42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1125 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1125  putative type VI secretion protein VasJ  100 
 
 		 513 aa  1038    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  27.55 
 
 		 518 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  28.89 
 
 		 518 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  30.14 
 
 		 520 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  27.76 
 
 		 518 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  28.51 
 
 		 520 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3721  ImpA domain-containing protein  23.06 
 
 		 482 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0056  ImpA domain-containing protein  23.36 
 
 		 480 aa  123  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2517  type VI secretion-associated protein  23.9 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0018  hypothetical protein  21.49 
 
 		 469 aa  103  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0325  ImpA domain-containing protein  23.14 
 
 		 462 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0398  type VI secretion-associated protein  23.14 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1219  ImpA domain-containing protein  22.56 
 
 		 470 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.192362 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1082  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  20.35 
 
 		 475 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.424761  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1208  ImpA domain-containing protein  19.54 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  22.86 
 
 		 527 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  21.25 
 
 		 522 aa  87.4  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3243  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  22.64 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1100  type VI secretion-associated protein, family  22.71 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  21.55 
 
 		 524 aa  84  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2795  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  20 
 
 		 479 aa  83.2  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  20.16 
 
 		 789 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  20.74 
 
 		 790 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0227  ImpA domain-containing protein  21.11 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0229  ImpA domain-containing protein  20.59 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.865531  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0235  ImpA domain protein  21.74 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  21.1 
 
 		 533 aa  79  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  22.31 
 
 		 523 aa  78.2  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  21.68 
 
 		 528 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  20.83 
 
 		 534 aa  73.2  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  20.3 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  22.06 
 
 		 530 aa  65.1  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  20.3 
 
 		 533 aa  64.7  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  20.26 
 
 		 533 aa  64.3  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2626  hypothetical protein  19.66 
 
 		 487 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0739443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2129  ImpA domain-containing protein  19.61 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3222  type VI secretion-associated protein  24.84 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4072  hypothetical protein  18.85 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00713132  unclonable  0.00000101691 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0162  ImpA domain-containing protein  21 
 
 		 498 aa  57.8  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  26.35 
 
 		 508 aa  53.5  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  23.5 
 
 		 791 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1180  putative nucleobase:cation symporter  24.54 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>