176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1121 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1121  putative type VI secretion protein VasA  100 
 
 		 583 aa  1216    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0138508  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  42.21 
 
 		 596 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2546  hypothetical protein  42.33 
 
 		 595 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5586  hypothetical protein  41.78 
 
 		 595 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3612  hypothetical protein  40.44 
 
 		 595 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  35.06 
 
 		 590 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  36.83 
 
 		 588 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  35.92 
 
 		 582 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  35.92 
 
 		 582 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  34.18 
 
 		 587 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43000  hypothetical protein  35.86 
 
 		 526 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.333671 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  35.61 
 
 		 588 aa  357  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5427  hypothetical protein  36.1 
 
 		 517 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  35.44 
 
 		 588 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  35.55 
 
 		 589 aa  351  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.11 
 
 		 588 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3252  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.28 
 
 		 588 aa  349  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  34.61 
 
 		 588 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.94 
 
 		 588 aa  347  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0389  type VI secretion protein  34.63 
 
 		 606 aa  343  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0316  hypothetical protein  34.63 
 
 		 606 aa  343  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2526  type VI secretion protein  34.78 
 
 		 588 aa  342  9e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1199  hypothetical protein  34.17 
 
 		 588 aa  342  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.241231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1227  hypothetical protein  32.42 
 
 		 617 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.366123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0431  hypothetical protein  33.56 
 
 		 577 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1108  type VI secretion protein, family  32.1 
 
 		 617 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3313  hypothetical protein  32.24 
 
 		 576 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0243  hypothetical protein  30.83 
 
 		 616 aa  310  5e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.956418 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0235  hypothetical protein  30.83 
 
 		 616 aa  310  5e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0237  hypothetical protein  30.83 
 
 		 616 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0740  hypothetical protein  30.46 
 
 		 580 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0608  hypothetical protein  30.46 
 
 		 580 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301701  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0719  hypothetical protein  30.46 
 
 		 580 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133879  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2029  hypothetical protein  30.46 
 
 		 580 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1677  hypothetical protein  30.46 
 
 		 580 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2127  hypothetical protein  30.29 
 
 		 580 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0538  hypothetical protein  30.29 
 
 		 580 aa  296  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0635  hypothetical protein  31.04 
 
 		 606 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0758526 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0866  hypothetical protein  29.88 
 
 		 580 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5273  hypothetical protein  29.63 
 
 		 608 aa  257  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3657  type VI secretion protein  27.78 
 
 		 604 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360075  normal  0.494654 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  30.87 
 
 		 611 aa  253  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2818  hypothetical protein  28.52 
 
 		 585 aa  251  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  29.26 
 
 		 606 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  29.1 
 
 		 606 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  29.74 
 
 		 610 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  29.1 
 
 		 606 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  29.44 
 
 		 606 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  28.32 
 
 		 592 aa  227  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.26 
 
 		 590 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3245  type VI secretion protein  28.28 
 
 		 589 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  27.71 
 
 		 611 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  27.71 
 
 		 611 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  27.71 
 
 		 611 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.86 
 
 		 590 aa  226  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  27.72 
 
 		 612 aa  223  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  27.39 
 
 		 611 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  28.5 
 
 		 610 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  27.39 
 
 		 611 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  27.23 
 
 		 611 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1800  hypothetical protein  26.9 
 
 		 584 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765675  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2489  hypothetical protein  26.69 
 
 		 587 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2587  type VI secretion protein  26.69 
 
 		 587 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  27.23 
 
 		 611 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0800  hypothetical protein  26.52 
 
 		 587 aa  221  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2993  hypothetical protein  26.69 
 
 		 587 aa  219  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000448613 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  27.91 
 
 		 612 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  27.91 
 
 		 612 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  27.91 
 
 		 612 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  27.91 
 
 		 612 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  27.72 
 
 		 612 aa  219  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.79 
 
 		 612 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  27.06 
 
 		 589 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  27.11 
 
 		 611 aa  210  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  27.36 
 
 		 616 aa  207  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  27.01 
 
 		 586 aa  199  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  24.45 
 
 		 628 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  24.8 
 
 		 605 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  24.68 
 
 		 623 aa  185  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  25.27 
 
 		 624 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  24.12 
 
 		 620 aa  184  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  25.55 
 
 		 619 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  25.08 
 
 		 619 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  26.27 
 
 		 593 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  24.29 
 
 		 629 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  25.43 
 
 		 629 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  25.43 
 
 		 629 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  25.32 
 
 		 609 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  25.43 
 
 		 629 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  24.96 
 
 		 623 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  25.43 
 
 		 629 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  25.43 
 
 		 629 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  25.43 
 
 		 629 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  24.32 
 
 		 623 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  25.27 
 
 		 629 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  24.32 
 
 		 623 aa  174  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  24.32 
 
 		 623 aa  174  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  24.32 
 
 		 623 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  24.32 
 
 		 623 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  24.32 
 
 		 623 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>