266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1096 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  361  3e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  65.54 
 
 
177 aa  246  9e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  63.84 
 
 
178 aa  244  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  64.97 
 
 
178 aa  243  9e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  55.37 
 
 
181 aa  215  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.28 
 
 
176 aa  199  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.85 
 
 
181 aa  199  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  43.68 
 
 
173 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  43.75 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.29 
 
 
183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.01 
 
 
178 aa  135  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  39.2 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  39.55 
 
 
180 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  39.88 
 
 
390 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  37.29 
 
 
199 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  36.72 
 
 
178 aa  121  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  42.21 
 
 
181 aa  120  9e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.68 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  34.68 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  42.21 
 
 
181 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.1 
 
 
175 aa  111  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  37.08 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.09 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.92 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  39.02 
 
 
176 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  40.13 
 
 
184 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  35.84 
 
 
183 aa  104  6e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  32.57 
 
 
175 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.46 
 
 
184 aa  102  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06432  dihydrofolate reductase  61.33 
 
 
75 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03197  dihydrofolate reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G06820)  33.85 
 
 
210 aa  101  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.245608 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  32.95 
 
 
175 aa  99.4  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  32.95 
 
 
176 aa  99  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  33.71 
 
 
194 aa  98.6  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  35.84 
 
 
180 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  36.3 
 
 
177 aa  97.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  36.3 
 
 
177 aa  97.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  34.5 
 
 
180 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  31.4 
 
 
177 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.86 
 
 
174 aa  93.6  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  33.33 
 
 
174 aa  92  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  33.33 
 
 
173 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  32.72 
 
 
173 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  32.1 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3614  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.35 
 
 
186 aa  89.4  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  33.53 
 
 
192 aa  89  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  32.72 
 
 
173 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  32.72 
 
 
173 aa  88.2  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  32.72 
 
 
173 aa  88.2  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.54 
 
 
188 aa  88.2  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  32.72 
 
 
173 aa  87.4  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  32.92 
 
 
173 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  32.1 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  38.1 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  30.67 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.78 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  32.91 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.6 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  27.22 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  33.12 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  29.38 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  29.79 
 
 
191 aa  72  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.57 
 
 
193 aa  72  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.14 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  30 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  29.94 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.57 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  32 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  25.41 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  29.05 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.33 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.94 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.57 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  26.92 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  28.77 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.99 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.4 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  28.41 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  27.98 
 
 
221 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.73 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.17 
 
 
221 aa  61.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.34 
 
 
189 aa  60.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  26.11 
 
 
178 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  25.67 
 
 
195 aa  60.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.27 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.43 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.05 
 
 
221 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  30.3 
 
 
193 aa  58.9  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.32 
 
 
188 aa  58.9  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  26.6 
 
 
199 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.84 
 
 
199 aa  58.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.83 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.13 
 
 
199 aa  58.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.73 
 
 
182 aa  58.2  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>