164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1057 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  51.82 
 
 
600 aa  651    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  53.15 
 
 
602 aa  671    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  51.16 
 
 
602 aa  665    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  100 
 
 
601 aa  1240    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  41.47 
 
 
598 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  41.47 
 
 
598 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  41.47 
 
 
598 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  42.21 
 
 
593 aa  511  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  39.57 
 
 
586 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  39.57 
 
 
586 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  39.57 
 
 
586 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  39.57 
 
 
586 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  37.69 
 
 
582 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  39.57 
 
 
586 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  39.57 
 
 
586 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  39.57 
 
 
586 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  39.57 
 
 
586 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  39.57 
 
 
586 aa  468  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  39 
 
 
586 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  38.36 
 
 
582 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  39.33 
 
 
586 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  39.33 
 
 
586 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  39.33 
 
 
586 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  39.33 
 
 
586 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  39.33 
 
 
586 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  38.46 
 
 
590 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  38.13 
 
 
590 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  36.29 
 
 
580 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  35.37 
 
 
595 aa  371  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  33.39 
 
 
604 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  33.28 
 
 
595 aa  347  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  33.66 
 
 
596 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  33.06 
 
 
596 aa  345  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  33.33 
 
 
594 aa  345  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  33.5 
 
 
596 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  33.33 
 
 
596 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  33.99 
 
 
596 aa  341  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  33.66 
 
 
595 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  33.33 
 
 
595 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  33.5 
 
 
595 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  33.5 
 
 
595 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  33.28 
 
 
594 aa  339  7e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  32.52 
 
 
595 aa  335  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  33.55 
 
 
592 aa  331  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  32.69 
 
 
594 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  30.78 
 
 
613 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  29.3 
 
 
617 aa  281  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  29.3 
 
 
617 aa  281  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  29.93 
 
 
609 aa  273  9e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  25.81 
 
 
622 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  27.63 
 
 
615 aa  234  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  28.2 
 
 
611 aa  232  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  28.03 
 
 
607 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  28.77 
 
 
607 aa  224  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  24.72 
 
 
638 aa  197  6e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  25.21 
 
 
637 aa  196  7e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  24.56 
 
 
647 aa  196  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  25.04 
 
 
637 aa  193  7e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  25.25 
 
 
600 aa  191  4e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3380  alkaline phosphatase superfamily hydrolase  26.48 
 
 
509 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.99522  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  27.12 
 
 
625 aa  167  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2610  hypothetical protein  26.56 
 
 
586 aa  164  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0170  sulfatase  24.92 
 
 
635 aa  163  9e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2024  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  24.92 
 
 
638 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01909  Membrane-associated hydrolase of alkaline phosphatase superfamily protein  30.61 
 
 
508 aa  154  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.558956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  26.57 
 
 
624 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  25.78 
 
 
614 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52300  hypothetical protein  26.18 
 
 
642 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  26.54 
 
 
641 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  20.39 
 
 
621 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  20.29 
 
 
621 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  20.43 
 
 
621 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  20.75 
 
 
630 aa  71.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28950  arylsulfatase A family protein  29.63 
 
 
489 aa  59.7  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3685  sulfatase  27.63 
 
 
1009 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0329595  hitchhiker  0.00309505 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  37.36 
 
 
513 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  23.79 
 
 
491 aa  54.3  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  23.25 
 
 
471 aa  54.3  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  32.77 
 
 
511 aa  54.3  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1453  sulfatase  28.89 
 
 
450 aa  53.9  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  35.16 
 
 
515 aa  53.9  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  32.77 
 
 
511 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4030  sulfatase  19.81 
 
 
765 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.868128  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  35.16 
 
 
517 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  35.16 
 
 
522 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  31.93 
 
 
511 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  36.04 
 
 
516 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  30.69 
 
 
449 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  36.04 
 
 
516 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0987  metalloenzyme domain-containing protein  21.5 
 
 
428 aa  52.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  34.07 
 
 
512 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  35.16 
 
 
522 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  35.16 
 
 
522 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  35.16 
 
 
522 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  35.16 
 
 
517 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  35.16 
 
 
522 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1185  sulfatase  25.81 
 
 
495 aa  52  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  29.06 
 
 
482 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1088  sulfatase  25.81 
 
 
495 aa  52  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  35.14 
 
 
516 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>