More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0899 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0899  dihydropicolinate synthase  100 
 
 
297 aa  613  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.442458  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1374  dihydrodipicolinate synthetase family protein  73.31 
 
 
298 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2776  putative N-acetylneuraminate lyase  72.73 
 
 
297 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1400  dihydrodipicolinate synthetase  72.73 
 
 
297 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.13834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1293  putative N-acetylneuraminate lyase  72.73 
 
 
297 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.519377  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1522  dihydrodipicolinate synthetase  67 
 
 
301 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2213  N-acetylneuraminate lyase  39.93 
 
 
308 aa  231  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1946  dihydrodipicolinate synthetase  36.7 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191392  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3256  dihydrodipicolinate synthetase  36.14 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0185396  normal  0.0566926 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2063  N-acetylneuraminate lyase  35.57 
 
 
307 aa  196  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000571385  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3023  dihydrodipicolinate synthetase  37.59 
 
 
313 aa  192  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2625  dihydrodipicolinate synthetase  34.46 
 
 
315 aa  192  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0998284  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  28.48 
 
 
309 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  29.39 
 
 
297 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3573  dihydrodipicolinate synthetase  29.25 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.283076  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  29.32 
 
 
297 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  29.32 
 
 
297 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  29.32 
 
 
297 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  29.32 
 
 
297 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  27.08 
 
 
293 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  27.08 
 
 
293 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  27.55 
 
 
288 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  27.67 
 
 
297 aa  109  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  27.76 
 
 
288 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2156  dihydrodipicolinate synthetase  28.68 
 
 
298 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  26.07 
 
 
292 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  28.41 
 
 
297 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  28.41 
 
 
297 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  28.41 
 
 
297 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  28.41 
 
 
297 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  28.41 
 
 
297 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  28.41 
 
 
297 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  28.41 
 
 
297 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  28.41 
 
 
297 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  28.41 
 
 
297 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  26.76 
 
 
292 aa  105  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  26.76 
 
 
292 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  26.76 
 
 
292 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  26.76 
 
 
292 aa  105  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  26.76 
 
 
292 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  26.76 
 
 
292 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  26.76 
 
 
292 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  26.76 
 
 
292 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  26.62 
 
 
292 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  25.34 
 
 
290 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0039  N-acetylneuraminate lyase, putative  27.3 
 
 
305 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 
296 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  28.22 
 
 
302 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  26.96 
 
 
294 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  28.52 
 
 
295 aa  99.8  6e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  24.73 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31 
 
 
308 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  27.9 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  27.03 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  27.17 
 
 
302 aa  96.3  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  24.48 
 
 
295 aa  96.3  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  25.86 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  29.68 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  25.26 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  26.69 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18431  dihydrodipicolinate synthase  29.14 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1459  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.503779 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  25.26 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  27.14 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  26.22 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  27.7 
 
 
291 aa  94  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  27.72 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  26.35 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  25.52 
 
 
292 aa  93.6  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  27.03 
 
 
296 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  27.18 
 
 
290 aa  92.8  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  27.03 
 
 
296 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  26.45 
 
 
294 aa  92.4  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  26.21 
 
 
298 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  26.21 
 
 
298 aa  92.4  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  25.17 
 
 
298 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  26.21 
 
 
298 aa  92.4  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  25.52 
 
 
298 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1388  dihydrodipicolinate synthetase  27.05 
 
 
287 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.459727  normal  0.509229 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  24.48 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  23.92 
 
 
341 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1978  dihydrodipicolinate synthetase  28.07 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.578395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  27.05 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  24.48 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  24.92 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.72 
 
 
313 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  27.55 
 
 
292 aa  89.7  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 
290 aa  89  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  26.82 
 
 
288 aa  89  8e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2190  dihydrodipicolinate synthase  25.7 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  25.93 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  27.64 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  24.83 
 
 
289 aa  87.4  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  25.98 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  25.85 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>