More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0890 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0890  50S ribosomal protein L31 type B  100 
 
 		 85 aa  179  9.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03250  50S ribosomal protein L31 type B  75.31 
 
 		 86 aa  140  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002727  LSU ribosomal protein L31p  70.24 
 
 		 86 aa  137  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0694209  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0402  50S ribosomal protein L31 type B  72.84 
 
 		 85 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000944485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17700  50S ribosomal protein L31 type B  66.27 
 
 		 87 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1540  50S ribosomal protein L31 type B  65.06 
 
 		 87 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.267597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4183  ribosomal protein L31  61.73 
 
 		 93 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280608  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3920  50S ribosomal protein L31 type B  63.29 
 
 		 93 aa  116  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348577  normal  0.176876 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1916  50S ribosomal protein L31 type B  61.9 
 
 		 93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000248892  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0507  50S ribosomal protein L31 type B  61.9 
 
 		 92 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2207  50S ribosomal protein L31 type B  61.9 
 
 		 93 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0240279  normal  0.0216072 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00255  50S ribosomal protein L31  62.03 
 
 		 87 aa  107  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3308  ribosomal protein L31  62.03 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010761  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0307  50S ribosomal protein L31 type B  62.03 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798322  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0324  50S ribosomal protein L31 type B  62.03 
 
 		 87 aa  107  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000277542  normal  0.105012 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0342  50S ribosomal protein L31 type B  62.03 
 
 		 87 aa  107  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3323  50S ribosomal protein L31 type B  62.03 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00259  hypothetical protein  62.03 
 
 		 87 aa  107  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1330  50S ribosomal protein L31 type B  60.76 
 
 		 87 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0350  50S ribosomal protein L31 type B  60.76 
 
 		 87 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.380768  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1727  50S ribosomal protein L31 type B  58.23 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000829629  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2156  50S ribosomal protein L31 type B  58.23 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.475244  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2194  50S ribosomal protein L31 type B  58.23 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0620281  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3069  50S ribosomal protein L31 type B  55.95 
 
 		 86 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.10259e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3210  50S ribosomal protein L31 type B  55.95 
 
 		 86 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000321359  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0934  50S ribosomal protein L31 type B  56.79 
 
 		 86 aa  103  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.626009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2751  50S ribosomal protein L31 type B  53.01 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.178212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3243  50S ribosomal protein L31 type B  58.23 
 
 		 82 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1125  50S ribosomal protein L31 type B  58.23 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000113817  unclonable  0.00000000942965 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1068  50S ribosomal protein L31 type B  58.23 
 
 		 82 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.788899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3049  ribosomal protein L31  58.23 
 
 		 83 aa  101  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0096084  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1182  50S ribosomal protein L31 type B  50.59 
 
 		 87 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000836731  normal  0.323446 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2120  50S ribosomal protein L31 type B  54.12 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125341  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2250  50S ribosomal protein L31 type B  51.81 
 
 		 87 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0519  50S ribosomal protein L31 type B  53.01 
 
 		 86 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000807514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0572  50S ribosomal protein L31 type B  53.01 
 
 		 86 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0513  50S ribosomal protein L31 type B  53.01 
 
 		 86 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0529  50S ribosomal protein L31 type B  53.01 
 
 		 86 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000296903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0510  50S ribosomal protein L31 type B  53.01 
 
 		 86 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000510204  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0758  hypothetical protein  56.41 
 
 		 82 aa  97.4  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0637  50S ribosomal protein L31 type B  53.75 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1117  50S ribosomal protein L31 type B  54.12 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0238519  normal  0.245393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1025  50S ribosomal protein L31 type B  54.12 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.010082  normal  0.336183 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2291  50S ribosomal protein L31P  50.63 
 
 		 80 aa  96.7  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000143826  normal  0.236339 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1878  50S ribosomal protein L31 type B  50 
 
 		 85 aa  95.9  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793429 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5458  50S ribosomal protein L31 type B  51.9 
 
 		 81 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7574  ribosomal protein L31  54.43 
 
 		 81 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5180  50S ribosomal protein L31 type B  51.9 
 
 		 81 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00675998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5015  50S ribosomal protein L31 type B  51.9 
 
 		 81 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.65969e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5031  50S ribosomal protein L31 type B  51.9 
 
 		 81 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000768356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5509  50S ribosomal protein L31 type B  51.9 
 
 		 81 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1309  50S ribosomal protein L31 type B  54.43 
 
 		 115 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5574  50S ribosomal protein L31 type B  51.9 
 
 		 81 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000588465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5423  50S ribosomal protein L31 type B  51.9 
 
 		 81 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.27581e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5454  50S ribosomal protein L31 type B  51.9 
 
 		 81 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000123612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3852  50S ribosomal protein L31 type B  51.9 
 
 		 81 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000664047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5498  50S ribosomal protein L31 type B  51.9 
 
 		 81 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000131175  unclonable  2.48072e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5129  50S ribosomal protein L31 type B  51.9 
 
 		 81 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000037521  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0947  50S ribosomal protein L31 type B  55 
 
 		 87 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.589085  normal  0.576162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2137  50S ribosomal protein L31P  54.22 
 
 		 86 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171095  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1654  50S ribosomal protein L31P  59.15 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0873  50S ribosomal protein L31 type B  51.9 
 
 		 80 aa  94.4  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00543783  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0233  50S ribosomal protein L31 type B  49.37 
 
 		 81 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000024812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4415  ribosomal protein L31  55.7 
 
 		 83 aa  94  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000833435  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0489  50S ribosomal protein L31P  52.56 
 
 		 80 aa  94  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2127  50S ribosomal protein L31 type B  48.81 
 
 		 85 aa  93.6  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.029329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1557  ribosomal protein L31  52.56 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0965465  decreased coverage  0.00916576 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3254  50S ribosomal protein L31 type B  49.37 
 
 		 80 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02360  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 		 80 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2367  50S ribosomal protein L31 type B  53.49 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000177904  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0786  50S ribosomal protein L31 type B  51.9 
 
 		 80 aa  91.7  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1820  50S ribosomal protein L31 type B  53.75 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0400323 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1703  50S ribosomal protein L31 type B  48.1 
 
 		 81 aa  90.5  8e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36470  LSU ribosomal protein L31P  51.9 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4370  ribosomal protein L31  51.28 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.0154955 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1369  50S ribosomal protein L31 type B  51.25 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00759194  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2215  50S ribosomal protein L31 type B  51.25 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2380  50S ribosomal protein L31 type B  51.25 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2253  50S ribosomal protein L31 type B  51.25 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.081991  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1131  50S ribosomal protein L31 type B  51.25 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.297001  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1860  50S ribosomal protein L31 type B  51.25 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0037  50S ribosomal protein L31 type B  51.25 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0133006  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11640  LSU ribosomal protein L31P  46.43 
 
 		 85 aa  88.6  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2213  50S ribosomal protein L31 type B  51.25 
 
 		 87 aa  88.6  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3270  ribosomal protein L31  49.37 
 
 		 80 aa  88.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1771  50S ribosomal protein L31 type B  51.25 
 
 		 87 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1744  50S ribosomal protein L31 type B  51.25 
 
 		 87 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372125  normal  0.163182 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0263  50S ribosomal protein L31 type B  45.57 
 
 		 83 aa  87.4  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3289  ribosomal protein L31  45.88 
 
 		 87 aa  87.4  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399256  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6358  ribosomal protein L31  50.63 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5333  50S ribosomal protein L31 type B  45.88 
 
 		 91 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5134  50S ribosomal protein L31 type B  50 
 
 		 86 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.593671  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2261  50S ribosomal protein L31P  52.94 
 
 		 93 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6211  ribosomal protein L31  51.25 
 
 		 83 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1440  50S ribosomal protein L31 type B  50 
 
 		 87 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219049  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2857  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14801  normal  0.329217 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6246  50S ribosomal protein L31 type B  51.25 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235977  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0234  50S ribosomal protein L31 type B  48.72 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0913753  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1833  50S ribosomal protein L31 type B  51.25 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.012708  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2197  ribosomal protein L31  55 
 
 		 97 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>