More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0852 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  100 
 
 
297 aa  618  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  51.72 
 
 
295 aa  310  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  50 
 
 
293 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1667  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  48.46 
 
 
297 aa  281  7e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  40.37 
 
 
321 aa  250  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  6.94266e-06  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  43.94 
 
 
318 aa  243  2e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  2.51275e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  43.94 
 
 
318 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.30529e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  40.25 
 
 
339 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.06 
 
 
339 aa  239  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  40.62 
 
 
310 aa  238  8e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  40.69 
 
 
310 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.93 
 
 
310 aa  234  1e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  1.65105e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.93 
 
 
310 aa  234  2e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.93 
 
 
310 aa  234  2e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  6.50264e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  39.93 
 
 
310 aa  234  2e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.25 
 
 
314 aa  233  2e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.93 
 
 
310 aa  234  2e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  39.93 
 
 
328 aa  234  2e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  9.35054e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.25 
 
 
314 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.25 
 
 
314 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.58 
 
 
352 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.25 
 
 
314 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.25 
 
 
314 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  39.26 
 
 
314 aa  229  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.25 
 
 
340 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  37.13 
 
 
340 aa  219  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  34.48 
 
 
307 aa  201  1e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1122  periplasmic solute binding protein  35.58 
 
 
328 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  35.21 
 
 
313 aa  198  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  33.1 
 
 
307 aa  196  5e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  34.88 
 
 
302 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  34.8 
 
 
309 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  33.45 
 
 
297 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  34.01 
 
 
308 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  33.11 
 
 
318 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2751  periplasmic solute binding protein  35.09 
 
 
332 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 
302 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  33.55 
 
 
302 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  33.44 
 
 
334 aa  184  2e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  33.44 
 
 
334 aa  184  2e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  34.38 
 
 
344 aa  182  4e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 
303 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  33.76 
 
 
351 aa  180  3e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  31.8 
 
 
346 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  31.79 
 
 
313 aa  174  1e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 
329 aa  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5268  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  31.05 
 
 
311 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  30.4 
 
 
347 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  41.08 
 
 
371 aa  163  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 
287 aa  159  4e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  30.77 
 
 
282 aa  149  8e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1892  periplasmic solute binding protein  26.93 
 
 
321 aa  147  2e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00897518  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  26.26 
 
 
356 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0312  periplasmic solute binding protein  27.35 
 
 
362 aa  135  6e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  28.81 
 
 
301 aa  134  2e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4140  periplasmic solute binding protein  26.97 
 
 
326 aa  129  4e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.101102 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1256  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36 
 
 
372 aa  123  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000280798  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0188  periplasmic solute binding protein  25.07 
 
 
334 aa  122  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494723  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1712  periplasmic solute binding protein  28.92 
 
 
369 aa  120  2e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.333525  normal  0.532025 
 
 
-
 
NC_002978  WD0937  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  26.91 
 
 
293 aa  117  3e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.388709  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.44 
 
 
320 aa  115  8e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  23.55 
 
 
292 aa  112  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  28.46 
 
 
290 aa  110  2e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  24.71 
 
 
311 aa  110  2e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  27.17 
 
 
290 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  24.22 
 
 
309 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  24.74 
 
 
316 aa  105  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  26.59 
 
 
368 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3616  periplasmic solute binding protein  31.76 
 
 
378 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0144381 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3151  hypothetical protein  24.1 
 
 
336 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.506548 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  26.92 
 
 
290 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  26.77 
 
 
307 aa  103  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  26.15 
 
 
316 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  26.15 
 
 
316 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  25.8 
 
 
316 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  24.6 
 
 
303 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  25.8 
 
 
316 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  24.9 
 
 
302 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.73282e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  23.4 
 
 
300 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  24.38 
 
 
316 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  24.38 
 
 
316 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  25.19 
 
 
315 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  24.19 
 
 
282 aa  99.8  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  24.38 
 
 
316 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  22.62 
 
 
312 aa  99.4  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  24.91 
 
 
365 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  22.44 
 
 
294 aa  99  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 
292 aa  99  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  27.51 
 
 
307 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  24.17 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0060  XRE family transcriptional regulator  29.04 
 
 
326 aa  98.2  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.741905  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  27.24 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4495  periplasmic solute binding protein  35.75 
 
 
350 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  23.44 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3571  ABC zinc transporter, periplasmic binding protein ZnuA  26.2 
 
 
345 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  24.03 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3253  periplasmic solute binding protein  26.03 
 
 
347 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0556768 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  24.83 
 
 
314 aa  96.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  23.76 
 
 
316 aa  96.3  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  24.64 
 
 
317 aa  95.9  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>