More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0705 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  68.66 
 
 		 469 aa  703    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  100 
 
 		 469 aa  976    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  48.09 
 
 		 467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  44.75 
 
 		 478 aa  404  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  43.19 
 
 		 478 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  41.94 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  42.46 
 
 		 468 aa  375  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  40.08 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  43.2 
 
 		 438 aa  350  2e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  41.7 
 
 		 461 aa  344  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  40.39 
 
 		 451 aa  335  7.999999999999999e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  39.39 
 
 		 452 aa  334  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  40.13 
 
 		 444 aa  333  3e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  39.66 
 
 		 452 aa  333  3e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  40.38 
 
 		 446 aa  330  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  38.88 
 
 		 458 aa  331  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  40.85 
 
 		 446 aa  330  3e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  38.33 
 
 		 478 aa  330  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  41.06 
 
 		 446 aa  329  6e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  40.81 
 
 		 446 aa  328  9e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  37.69 
 
 		 471 aa  326  5e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  39.19 
 
 		 478 aa  326  5e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  37.9 
 
 		 488 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  37.04 
 
 		 474 aa  323  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  37.55 
 
 		 453 aa  322  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  38.09 
 
 		 459 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  38.99 
 
 		 470 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  36.19 
 
 		 499 aa  315  9e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  38.2 
 
 		 909 aa  312  7.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  37.18 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  37.72 
 
 		 448 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1789  6-phospho-beta-galactosidase  39.03 
 
 		 470 aa  310  4e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  38.23 
 
 		 453 aa  309  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D39  6-phospho-beta-galactosidase  38.89 
 
 		 468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  37.04 
 
 		 447 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  37.66 
 
 		 457 aa  306  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  36.46 
 
 		 462 aa  306  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  36.73 
 
 		 448 aa  306  7e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  37.37 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2259  6-phospho-beta-galactosidase  38.51 
 
 		 470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2220  6-phospho-beta-galactosidase  38.51 
 
 		 470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  36.32 
 
 		 463 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  36.8 
 
 		 452 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  37.37 
 
 		 484 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  37.76 
 
 		 474 aa  303  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  35.82 
 
 		 487 aa  303  5.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  35.14 
 
 		 448 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  38.48 
 
 		 470 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  37.23 
 
 		 465 aa  301  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  36.09 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  37.23 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  35.91 
 
 		 475 aa  300  3e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  37.58 
 
 		 464 aa  300  4e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  36.83 
 
 		 476 aa  299  6e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  36.21 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  38.66 
 
 		 466 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  36.94 
 
 		 461 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  36.38 
 
 		 467 aa  297  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  36.46 
 
 		 456 aa  297  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  36.21 
 
 		 470 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  35.81 
 
 		 473 aa  297  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  37.37 
 
 		 474 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  38.25 
 
 		 482 aa  296  7e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  38.36 
 
 		 470 aa  295  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  36.51 
 
 		 500 aa  295  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  36.33 
 
 		 478 aa  294  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  35.42 
 
 		 463 aa  293  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  34.99 
 
 		 458 aa  294  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  36.93 
 
 		 482 aa  294  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  36.46 
 
 		 472 aa  293  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  34.72 
 
 		 479 aa  292  8e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  37.53 
 
 		 461 aa  292  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  35.78 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  35.92 
 
 		 479 aa  291  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  37.87 
 
 		 484 aa  290  3e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000215907  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  35.89 
 
 		 467 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3044  beta-glucosidase  37.29 
 
 		 461 aa  289  7e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3201  Beta-glucosidase  38 
 
 		 470 aa  289  8e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.281249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  34.99 
 
 		 439 aa  289  8e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  37.74 
 
 		 488 aa  288  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2324  glycoside hydrolase family protein  35.74 
 
 		 470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  37.25 
 
 		 440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  36.36 
 
 		 451 aa  287  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  33.55 
 
 		 468 aa  286  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  35.64 
 
 		 455 aa  286  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  35.42 
 
 		 449 aa  286  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  36.46 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  35.15 
 
 		 472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  36.36 
 
 		 468 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  34.13 
 
 		 447 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  35.73 
 
 		 474 aa  282  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  35.18 
 
 		 447 aa  282  7.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  35.05 
 
 		 466 aa  282  8.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  36.42 
 
 		 451 aa  282  9e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  34.71 
 
 		 443 aa  282  9e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  36.34 
 
 		 437 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  35.08 
 
 		 467 aa  282  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  35.19 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  36 
 
 		 475 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0979  Beta-glucosidase  35.79 
 
 		 475 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>