16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0677 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0677  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  442  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.208284  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00951  hypothetical protein  80.48 
 
 
211 aa  358  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3395  alternative oxidase  75.83 
 
 
211 aa  348  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.684782  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2564  alternative oxidase  55.96 
 
 
214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.592262  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1660  Alternative oxidase  52.33 
 
 
209 aa  229  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1930  putative oxidase  54.69 
 
 
232 aa  229  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.310424 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5295  alternative oxidase  54.31 
 
 
229 aa  228  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.736306  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1576  alternative oxidase  53.3 
 
 
229 aa  223  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0387907  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01500  alternative oxidase 1  48.52 
 
 
401 aa  169  4e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02099  Alternative oxidase, mitochondrial Precursor (EC 1.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P959]  45.4 
 
 
354 aa  167  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168616  normal  0.300538 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67332  Alternative oxidase, mitochondrial precursor (SHAM-sensitive terminal oxidase) (STO1)  44.25 
 
 
357 aa  159  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.537821  normal  0.0955633 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4977  predicted protein  40 
 
 
221 aa  160  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_4970  predicted protein  40 
 
 
221 aa  160  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1055  alternative oxidase  24.87 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000214827  hitchhiker  0.0000989196 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0439  plastoquinol terminal oxidase  26.47 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0881752  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_10319  predicted protein  23.68 
 
 
240 aa  42.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0970285  normal  0.563011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>