238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0470 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0470  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHM)  100 
 
 		 282 aa  585  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00298128  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2821  MSHA biogenesis protein MshM  58.72 
 
 		 281 aa  342  4e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03697  Type II secretory pathway, component ExeA  57.14 
 
 		 261 aa  319  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002369  MSHA biogenesis protein MshM  57.09 
 
 		 261 aa  317  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  52.5 
 
 		 302 aa  280  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  54.1 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  53.9 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  54.1 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  53.9 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  53.26 
 
 		 308 aa  276  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  51.61 
 
 		 309 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  52.14 
 
 		 310 aa  274  9e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  51.25 
 
 		 309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  53.53 
 
 		 314 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  52.5 
 
 		 301 aa  271  9e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  53.11 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  50.71 
 
 		 302 aa  268  7e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  51.67 
 
 		 302 aa  268  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  53.16 
 
 		 304 aa  267  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  51.82 
 
 		 300 aa  265  7e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  46.24 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  46.85 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  46.62 
 
 		 300 aa  241  7.999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00252  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshM (pilus type IV)  48.15 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  45.02 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  43.07 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0765  type II secretory pathway component ATPase  42.75 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00521912  normal  0.0426164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  43.91 
 
 		 279 aa  209  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  39.22 
 
 		 296 aa  208  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  41.55 
 
 		 459 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  40.23 
 
 		 447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  41.82 
 
 		 275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  39.29 
 
 		 549 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  37.32 
 
 		 437 aa  183  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  38.55 
 
 		 563 aa  182  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.23 
 
 		 536 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3331  general secretion pathway protein, ATPase  35.49 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0818579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.98 
 
 		 536 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1342  MSHA biogenesis protein MshM  40.32 
 
 		 307 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.577962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  39 
 
 		 558 aa  178  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  37.79 
 
 		 303 aa  178  9e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  36.84 
 
 		 563 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.43 
 
 		 562 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.77 
 
 		 538 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  37.75 
 
 		 368 aa  176  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  37.85 
 
 		 563 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.77 
 
 		 536 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  37.12 
 
 		 541 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.77 
 
 		 541 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  36.92 
 
 		 540 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  38.29 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.23 
 
 		 562 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.96 
 
 		 564 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  35.19 
 
 		 584 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  35.07 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.82 
 
 		 613 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  37.12 
 
 		 538 aa  169  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  39.54 
 
 		 519 aa  168  8e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.6 
 
 		 587 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  37.17 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.43 
 
 		 557 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.43 
 
 		 557 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.43 
 
 		 557 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.43 
 
 		 557 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.32 
 
 		 589 aa  166  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  35.9 
 
 		 554 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.67 
 
 		 562 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.6 
 
 		 559 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.16 
 
 		 572 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.45 
 
 		 532 aa  159  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  38.43 
 
 		 529 aa  159  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  42.51 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.26 
 
 		 557 aa  158  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  37.04 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.03 
 
 		 568 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 562 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.06 
 
 		 556 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 562 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 562 aa  156  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  33.33 
 
 		 422 aa  156  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.41 
 
 		 580 aa  155  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 		 577 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  33.57 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  33.57 
 
 		 372 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  36.74 
 
 		 393 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  34.29 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  32.82 
 
 		 281 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  32.85 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  37.2 
 
 		 395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  33.59 
 
 		 505 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  34.2 
 
 		 357 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  36.43 
 
 		 831 aa  145  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  34.22 
 
 		 302 aa  145  9e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  33.83 
 
 		 371 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  35.34 
 
 		 390 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  33.33 
 
 		 395 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  35.53 
 
 		 381 aa  143  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  36.33 
 
 		 334 aa  142  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  31.2 
 
 		 388 aa  142  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  33.7 
 
 		 498 aa  142  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>