More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0451 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  100 
 
 
401 aa  833    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  59.75 
 
 
403 aa  519  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  60.5 
 
 
403 aa  513  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  61.75 
 
 
404 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  37.09 
 
 
409 aa  272  9e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  35.41 
 
 
426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
415 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 
414 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
415 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
405 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  29.95 
 
 
401 aa  216  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
394 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
410 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  29.18 
 
 
384 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
392 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 
404 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
391 aa  179  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
403 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
390 aa  177  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
392 aa  162  7e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
393 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
401 aa  159  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
426 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
387 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
423 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
539 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
424 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4354  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
402 aa  119  9e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 
398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
435 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2224  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
434 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307523  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  27.27 
 
 
778 aa  110  5e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  28.61 
 
 
413 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
413 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
405 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
418 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
447 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
425 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2500  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
434 aa  103  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
355 aa  102  9e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  27 
 
 
425 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2182  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
443 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347756  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  33.67 
 
 
365 aa  99.4  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
358 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3926  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 
410 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760133 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
403 aa  97.4  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  25 
 
 
403 aa  97.4  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1720  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
422 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
440 aa  97.1  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
355 aa  96.3  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
355 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
441 aa  94.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
419 aa  93.6  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 
406 aa  93.2  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
364 aa  93.2  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2590  glycosyl transferase, group 1  23.02 
 
 
410 aa  92.8  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
440 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.56 
 
 
412 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2017  glycosyltransferase  25.46 
 
 
389 aa  92  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.641598  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  24.25 
 
 
401 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
353 aa  90.9  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
409 aa  90.5  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1719  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 
421 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0471  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
422 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  22.15 
 
 
445 aa  89.7  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4615  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352309  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 
353 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
385 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
385 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
428 aa  87.4  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
378 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
390 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  25.61 
 
 
935 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3540  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
431 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.782852  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  29.85 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
536 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
424 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  27.71 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5224  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  22.84 
 
 
389 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  31.46 
 
 
383 aa  82.8  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>