59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0094 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0094    100 
 
 		 1732 bp  3433    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143123  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  79.05 
 
 		 1716 bp  242  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  77.89 
 
 		 1701 bp  236  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  80 
 
 		 1716 bp  190  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  78.12 
 
 		 1716 bp  170  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5354  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  90.91 
 
 		 975 bp  69.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1080  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  87.88 
 
 		 1044 bp  67.9  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1303  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  87.88 
 
 		 1044 bp  67.9  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.92932  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0918  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  97.3 
 
 		 2034 bp  65.9  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1086  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  88.33 
 
 		 1044 bp  63.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0660  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  97.14 
 
 		 1020 bp  61.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.553387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0627  ABC transporter nucleotide-binding protein  97.14 
 
 		 948 bp  61.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0717  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  97.14 
 
 		 1020 bp  61.9  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000354722 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0789  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  97.14 
 
 		 1020 bp  61.9  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00764009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0728  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  97.14 
 
 		 1020 bp  61.9  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.604641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00643  ABC oligopeptide transporter ATPase component  90 
 
 		 873 bp  60  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03426  hypothetical protein  100 
 
 		 984 bp  60  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1341  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  86.36 
 
 		 1044 bp  60  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000765858  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  91.3 
 
 		 876 bp  60  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2298  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  88.68 
 
 		 1005 bp  58  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.322598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4338  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  87.5 
 
 		 1005 bp  56  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.301077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1264  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  86.67 
 
 		 1044 bp  56  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1194  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  86.67 
 
 		 1044 bp  56  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118138  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5293  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  87.5 
 
 		 885 bp  56  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1104  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  86.67 
 
 		 1044 bp  56  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0251  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  90.91 
 
 		 981 bp  56  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0252  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  92.31 
 
 		 966 bp  54  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02946  oligopeptide transporter ATP-binding component  94.29 
 
 		 975 bp  54  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0227  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  89.36 
 
 		 939 bp  54  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  94.29 
 
 		 984 bp  54  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0394  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  87.04 
 
 		 939 bp  52  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  92.11 
 
 		 1878 bp  52  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0808  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 1182 bp  52  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3475  ABC transporter related  92.11 
 
 		 1611 bp  52  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0045  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  84.62 
 
 		 999 bp  50.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1929  ABC transporter related  87.76 
 
 		 816 bp  50.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0899  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  86.79 
 
 		 1044 bp  50.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.61652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0248  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  84.62 
 
 		 981 bp  50.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0799  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  90.24 
 
 		 1740 bp  50.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0467  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  96.43 
 
 		 999 bp  48.1  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0177179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0212  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  93.75 
 
 		 981 bp  48.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0477  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  93.75 
 
 		 1026 bp  48.1  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000893655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0759  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  85.71 
 
 		 1062 bp  48.1  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5076  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  93.75 
 
 		 966 bp  48.1  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.831918  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  93.75 
 
 		 981 bp  48.1  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0932  ABC transporter related  90 
 
 		 822 bp  48.1  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.68534  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0957  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  93.75 
 
 		 1167 bp  48.1  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.750532  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0221  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  93.75 
 
 		 981 bp  48.1  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0844  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  88.64 
 
 		 1053 bp  48.1  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0234  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  93.75 
 
 		 981 bp  48.1  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0244  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  93.75 
 
 		 981 bp  48.1  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0269  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  93.75 
 
 		 981 bp  48.1  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0146  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  93.75 
 
 		 984 bp  48.1  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1415  oligopeptide transporter ATP-binding component  90 
 
 		 1014 bp  48.1  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.62339  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0506  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  88.64 
 
 		 1023 bp  48.1  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.408902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0574  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  93.75 
 
 		 1020 bp  48.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1686  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  88.64 
 
 		 1023 bp  48.1  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.62904  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1385  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  88.64 
 
 		 1008 bp  48.1  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0188  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  93.75 
 
 		 1011 bp  48.1  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>