29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0055 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0055    100 
 
 		 1281 bp  2539    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.752795  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002041  acetolactate synthase large subunit  79.65 
 
 		 1266 bp  147  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2488  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  81.1 
 
 		 1647 bp  123  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.818345  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00410  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  78.25 
 
 		 1647 bp  109  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4843  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  82.2 
 
 		 1566 bp  67.9  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0526  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  84.44 
 
 		 1764 bp  67.9  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4126  acetolactate synthase large subunit  97.22 
 
 		 1917 bp  63.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  92.68 
 
 		 1719 bp  58  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0345  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  92.68 
 
 		 1710 bp  58  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0918871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1120  acetolactate synthase catalytic subunit  100 
 
 		 1701 bp  58  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000146949  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3281  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  92.68 
 
 		 1671 bp  58  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  92.68 
 
 		 1719 bp  58  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0422  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  94.59 
 
 		 1668 bp  58  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  92.68 
 
 		 1719 bp  58  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0147  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  83.75 
 
 		 1677 bp  56  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  92.31 
 
 		 1740 bp  54  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  100 
 
 		 1899 bp  52  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0442  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  88 
 
 		 1689 bp  52  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2114  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  100 
 
 		 1698 bp  50.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05901  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  96.55 
 
 		 1764 bp  50.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1959  acetolactate synthase, large subunit  100 
 
 		 1713 bp  50.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  90.24 
 
 		 1719 bp  50.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3414  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  90.24 
 
 		 1674 bp  50.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02570  acetolactate synthase, putative  100 
 
 		 2636 bp  48.1  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0929  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  93.75 
 
 		 1860 bp  48.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0902  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  93.75 
 
 		 1860 bp  48.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0810  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  93.75 
 
 		 1788 bp  48.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.845021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3746  acetolactate synthase, large subunit  88.64 
 
 		 1722 bp  48.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4009  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  88.64 
 
 		 1674 bp  48.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>