More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0053 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0053  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 490 aa  1009    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002038  dihydroxy-acid dehydratase  93.1 
 
 		 613 aa  571  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2491  dihydroxy-acid dehydratase  92.41 
 
 		 613 aa  566  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4205  dihydroxy-acid dehydratase  89.27 
 
 		 616 aa  555  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00333285  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4282  dihydroxy-acid dehydratase  89.27 
 
 		 616 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4137  dihydroxy-acid dehydratase  89.27 
 
 		 616 aa  555  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.129603  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03649  dihydroxy-acid dehydratase  88.93 
 
 		 616 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000570599  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4231  dihydroxy-acid dehydratase  88.93 
 
 		 616 aa  553  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03598  hypothetical protein  88.93 
 
 		 616 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000482952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5205  dihydroxy-acid dehydratase  88.93 
 
 		 616 aa  553  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3988  dihydroxy-acid dehydratase  88.93 
 
 		 616 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4012  dihydroxy-acid dehydratase  89.27 
 
 		 616 aa  553  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0176086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4029  dihydroxy-acid dehydratase  88.97 
 
 		 616 aa  553  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4149  dihydroxy-acid dehydratase  89.27 
 
 		 616 aa  555  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4114  dihydroxy-acid dehydratase  88.93 
 
 		 616 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4757  dihydroxy-acid dehydratase  88.28 
 
 		 616 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0890902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4294  dihydroxy-acid dehydratase  88.58 
 
 		 616 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0141  dihydroxy-acid dehydratase  89.62 
 
 		 616 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4129  dihydroxy-acid dehydratase  88.58 
 
 		 616 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4186  dihydroxy-acid dehydratase  88.58 
 
 		 616 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4235  dihydroxy-acid dehydratase  88.58 
 
 		 616 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.866608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4218  dihydroxy-acid dehydratase  87.24 
 
 		 616 aa  541  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00413  dihydroxy-acid dehydratase  92.09 
 
 		 599 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3773  dihydroxy-acid dehydratase  86.9 
 
 		 616 aa  536  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125005  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4057  dihydroxy-acid dehydratase  85.86 
 
 		 616 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0157  dihydroxy-acid dehydratase  85.86 
 
 		 616 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0485  dihydroxy-acid dehydratase  85.86 
 
 		 616 aa  533  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.543148 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4846  dihydroxy-acid dehydratase  86.51 
 
 		 620 aa  529  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0807241  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0342  dihydroxy-acid dehydratase  86.85 
 
 		 611 aa  529  1e-149  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4162  dihydroxy-acid dehydratase  87.24 
 
 		 616 aa  531  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0348  dihydroxy-acid dehydratase  86.16 
 
 		 615 aa  526  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0364  dihydroxy-acid dehydratase  83.28 
 
 		 619 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3662  dihydroxy-acid dehydratase  83.28 
 
 		 619 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0358  dihydroxy-acid dehydratase  83.28 
 
 		 619 aa  525  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3932  dihydroxy-acid dehydratase  85.12 
 
 		 624 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4126  dihydroxy-acid dehydratase  85.12 
 
 		 624 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3612  dihydroxy-acid dehydratase  85.12 
 
 		 619 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4007  dihydroxy-acid dehydratase  85.12 
 
 		 624 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4029  dihydroxy-acid dehydratase  85.12 
 
 		 624 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4345  dihydroxy-acid dehydratase  82.61 
 
 		 619 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0445  dihydroxy-acid dehydratase  86.16 
 
 		 616 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0424  dihydroxy-acid dehydratase  84.43 
 
 		 619 aa  519  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0292  dihydroxy-acid dehydratase  83.74 
 
 		 616 aa  518  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0346  dihydroxy-acid dehydratase  83.22 
 
 		 612 aa  518  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3279  dihydroxy-acid dehydratase  83.74 
 
 		 618 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3412  dihydroxy-acid dehydratase  82.35 
 
 		 619 aa  508  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4250  dihydroxy-acid dehydratase  84.14 
 
 		 615 aa  511  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0971242  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1151  dihydroxy-acid dehydratase  83.68 
 
 		 623 aa  510  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0302  dihydroxy-acid dehydratase  78.6 
 
 		 618 aa  506  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000297284  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2292  dihydroxy-acid dehydratase  67.91 
 
 		 615 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.809008  normal  0.0178596 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2001  dihydroxy-acid dehydratase  80.07 
 
 		 617 aa  501  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0112  dihydroxy-acid dehydratase  81.94 
 
 		 611 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0099  dihydroxy-acid dehydratase  81.94 
 
 		 611 aa  500  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0324836  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0097  dihydroxy-acid dehydratase  81.94 
 
 		 613 aa  500  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2423  dihydroxy-acid dehydratase  67.47 
 
 		 611 aa  498  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.421855  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5433  dihydroxyacid dehydratase  81.31 
 
 		 613 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535881  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0340  dihydroxy-acid dehydratase  80.28 
 
 		 616 aa  498  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2717  dihydroxy-acid dehydratase  79.19 
 
 		 617 aa  497  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52758  normal  0.12218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1829  dihydroxy-acid dehydratase  81.44 
 
 		 609 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184703  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3925  dihydroxy-acid dehydratase  79.79 
 
 		 612 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0469  dihydroxy-acid dehydratase  79.86 
 
 		 615 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2414  dihydroxy-acid dehydratase  79.58 
 
 		 611 aa  492  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0395754  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3074  dihydroxy-acid dehydratase  79.79 
 
 		 612 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.611367  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1361  dihydroxy-acid dehydratase  80.62 
 
 		 612 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0137226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0070  dihydroxy-acid dehydratase  67.29 
 
 		 617 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4321  dihydroxy-acid dehydratase  80.28 
 
 		 612 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.169432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2666  dihydroxy-acid dehydratase  81.6 
 
 		 611 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0446  dihydroxy-acid dehydratase  80.9 
 
 		 612 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04630  dihydroxy-acid dehydratase  80.9 
 
 		 612 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3801  dihydroxy-acid dehydratase  79.79 
 
 		 612 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.120257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5128  dihydroxy-acid dehydratase  79.11 
 
 		 613 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5057  dihydroxy-acid dehydratase  79.51 
 
 		 615 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1648  dihydroxy-acid dehydratase  79.38 
 
 		 618 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5358  dihydroxy-acid dehydratase  79.86 
 
 		 613 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1899  dihydroxy-acid dehydratase  77.44 
 
 		 619 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18498  normal  0.373013 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2035  dihydroxy-acid dehydratase  78.91 
 
 		 620 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.871737  hitchhiker  0.0000000266357 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2675  dihydroxy-acid dehydratase  80.62 
 
 		 611 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.272323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5002  dihydroxy-acid dehydratase  79.11 
 
 		 613 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.138711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4452  dihydroxy-acid dehydratase  76.64 
 
 		 619 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.941603 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0578  dihydroxy-acid dehydratase  76.92 
 
 		 635 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.104527  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2902  dihydroxy-acid dehydratase  80.62 
 
 		 611 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.25896 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03310  Dihydroxy-acid dehydratase  79.86 
 
 		 612 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1784  dihydroxy-acid dehydratase  77.85 
 
 		 615 aa  491  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272247  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2661  dihydroxy-acid dehydratase  78.57 
 
 		 620 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3804  dihydroxy-acid dehydratase  79.04 
 
 		 619 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0169  dihydroxy-acid dehydratase  79.24 
 
 		 613 aa  489  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4585  dihydroxy-acid dehydratase  78.91 
 
 		 620 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307553 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1189  dihydroxy-acid dehydratase  78.69 
 
 		 619 aa  491  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0336  dihydroxy-acid dehydratase  79.45 
 
 		 613 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2933  dihydroxy-acid dehydratase  80.48 
 
 		 612 aa  490  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2723  dihydroxy-acid dehydratase  80.28 
 
 		 612 aa  490  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2797  dihydroxy-acid dehydratase  80.62 
 
 		 611 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.830059  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1459  dihydroxy-acid dehydratase  79.93 
 
 		 612 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3508  dihydroxy-acid dehydratase  78.08 
 
 		 616 aa  487  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0213  dihydroxy-acid dehydratase  78.2 
 
 		 614 aa  488  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.450339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4656  dihydroxy-acid dehydratase  79.24 
 
 		 617 aa  488  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4231  dihydroxy-acid dehydratase  77.44 
 
 		 619 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5178  dihydroxy-acid dehydratase  79.58 
 
 		 613 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3234  dihydroxy-acid dehydratase  79.58 
 
 		 616 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00391519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1506  dihydroxy-acid dehydratase  76.32 
 
 		 619 aa  487  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>