176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0039 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  100 
 
 		 316 aa  654    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  85.94 
 
 		 320 aa  555  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3046  transposase  86.21 
 
 		 282 aa  518  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  54.63 
 
 		 319 aa  364  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  54.35 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  54.63 
 
 		 319 aa  364  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  54.63 
 
 		 319 aa  364  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  54.31 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  52.68 
 
 		 317 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  52.68 
 
 		 317 aa  361  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  54.26 
 
 		 313 aa  358  5e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  50 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  52.02 
 
 		 321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  49.68 
 
 		 304 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  49.37 
 
 		 304 aa  351  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  49.05 
 
 		 304 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  49.05 
 
 		 304 aa  349  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  54.29 
 
 		 309 aa  348  6e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  52.26 
 
 		 311 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  52.26 
 
 		 311 aa  342  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  51.94 
 
 		 311 aa  341  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  53.02 
 
 		 292 aa  340  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  53.02 
 
 		 292 aa  340  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  49.21 
 
 		 309 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  49.21 
 
 		 309 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  52.7 
 
 		 292 aa  338  5e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  52.7 
 
 		 292 aa  338  5e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  52.7 
 
 		 292 aa  338  5e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  52.7 
 
 		 292 aa  338  5e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  53.02 
 
 		 292 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  49.21 
 
 		 319 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  52.7 
 
 		 292 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  52.26 
 
 		 307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  51.75 
 
 		 292 aa  334  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  49.37 
 
 		 308 aa  332  6e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  49.53 
 
 		 313 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  49.53 
 
 		 313 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  49.53 
 
 		 313 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  48.73 
 
 		 300 aa  325  9e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  48.42 
 
 		 300 aa  324  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  48.42 
 
 		 300 aa  324  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  48.1 
 
 		 300 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  48.1 
 
 		 300 aa  318  6e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  47.27 
 
 		 299 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  47.78 
 
 		 296 aa  316  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  47.78 
 
 		 296 aa  316  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  47.78 
 
 		 296 aa  316  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  47.78 
 
 		 296 aa  315  6e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  47.78 
 
 		 296 aa  315  6e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  52.52 
 
 		 282 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  47.15 
 
 		 296 aa  310  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  46.62 
 
 		 299 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  46.67 
 
 		 334 aa  308  6.999999999999999e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  47.94 
 
 		 318 aa  308  8e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  48.25 
 
 		 314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  49.37 
 
 		 296 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  46.67 
 
 		 314 aa  293  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  51.76 
 
 		 255 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  46.78 
 
 		 310 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  48.74 
 
 		 313 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1547  putative transposase YhgA family protein  46.23 
 
 		 288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.738107  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  43.75 
 
 		 298 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  42.39 
 
 		 298 aa  273  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  43.28 
 
 		 302 aa  273  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  42.72 
 
 		 298 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  43 
 
 		 300 aa  271  7e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  42.35 
 
 		 300 aa  269  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  42.35 
 
 		 300 aa  269  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  42.35 
 
 		 300 aa  269  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  42.35 
 
 		 300 aa  269  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  40.78 
 
 		 306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3432  putative transposase YhgA family protein  48.67 
 
 		 218 aa  236  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0136  hypothetical protein  39.36 
 
 		 238 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  29.97 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04171  hypothetical protein  47.41 
 
 		 135 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04170  hypothetical protein  59.22 
 
 		 103 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.858892  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  27.59 
 
 		 308 aa  133  5e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1306  hypothetical protein  27.99 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  28.17 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  26.88 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  27.8 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  29.54 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  27.84 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  27.88 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  27.51 
 
 		 314 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  26.91 
 
 		 327 aa  96.7  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  27.36 
 
 		 337 aa  96.3  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4072  putative transposase  24.39 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  24.91 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4028  putative transposase  24.39 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  35.25 
 
 		 141 aa  90.1  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  29.61 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2307  hypothetical protein  24.84 
 
 		 321 aa  89.7  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000450312  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  27.45 
 
 		 343 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1722  hypothetical protein  27 
 
 		 308 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000483242  normal  0.789674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  26.64 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  25.07 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  26.73 
 
 		 333 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  25.48 
 
 		 345 aa  86.3  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1702  hypothetical protein  27.53 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>