12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0027 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0027  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  539  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0653  hypothetical protein  27.12 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.395081  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3495  hypothetical protein  27.43 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0798  hypothetical protein  26.94 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2029  hypothetical protein  24.84 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.721418  normal  0.623981 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1885  hypothetical protein  26.06 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911612 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08196  hypothetical protein  24.21 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000170796  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2823  hypothetical protein  23.23 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0074  hypothetical protein  30.91 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000070418  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0056  hypothetical protein  23.43 
 
 		 287 aa  48.5  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2315  hypothetical protein  26.17 
 
 		 296 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  hitchhiker  0.000000000000558489 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2563  hypothetical protein  23.76 
 
 		 304 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>