More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_p08245 on replicon NC_009777
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  100 
 
 		 179 aa  366  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  76.4 
 
 		 181 aa  295  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  75.84 
 
 		 179 aa  282  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  41.57 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  40.91 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  41.3 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  39.33 
 
 		 190 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  40.66 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  40.34 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  39.77 
 
 		 198 aa  130  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  38.64 
 
 		 185 aa  127  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  38.76 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  40.56 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  40.76 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  41.57 
 
 		 181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  40.76 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  41.44 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  41.01 
 
 		 197 aa  124  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  40.76 
 
 		 191 aa  124  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  37.91 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  37.84 
 
 		 205 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  37.7 
 
 		 186 aa  121  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  39.89 
 
 		 198 aa  121  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 185 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  38.33 
 
 		 180 aa  121  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  38.46 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  37.5 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  39.66 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  39.13 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  40.68 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  37.02 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 		 199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  38.33 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  38.2 
 
 		 180 aa  117  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  37.16 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  40.11 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  36.87 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  37.16 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  36.87 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  42.39 
 
 		 184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  37.57 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  37.57 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  37.99 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  37.5 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  40.76 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  38.76 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  36.61 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  36.31 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  38.2 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 199 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  36.67 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  37.16 
 
 		 185 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  37.16 
 
 		 185 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  36.26 
 
 		 188 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  37.02 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  37.43 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  35.68 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  37.99 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  35.71 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  35.71 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  39.78 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  36.26 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  37.84 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  36.16 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  37.29 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  35.71 
 
 		 212 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  37.84 
 
 		 184 aa  111  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  36.07 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  40.33 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  35.16 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  38.17 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  35.52 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  36.87 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  35.91 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  39.23 
 
 		 219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  39.04 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  41.22 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  34.64 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  35.52 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  37.08 
 
 		 185 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  35.68 
 
 		 196 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  35.68 
 
 		 196 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  35.52 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  35.68 
 
 		 196 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  35.71 
 
 		 182 aa  107  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  36.72 
 
 		 194 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 184 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  39.56 
 
 		 186 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  41.78 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>