More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_07029 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_07029  ABC-type transporter ATPase component  100 
 
 
232 aa  482  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000979  ABC transporter ATP-binding protein  96.98 
 
 
232 aa  471  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0382  ABC transporter, ATP-binding protein  65.09 
 
 
227 aa  304  8.000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2437  ABC transporter related  51.6 
 
 
231 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 
224 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  46.79 
 
 
230 aa  205  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2531  ABC transporter related  49.77 
 
 
228 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  43.35 
 
 
233 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  44.87 
 
 
237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  44.59 
 
 
277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  45.33 
 
 
266 aa  198  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  47.37 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  47.37 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0036  ABC transporter related  42.01 
 
 
232 aa  194  9e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00248641  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  44.49 
 
 
237 aa  194  9e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2280  ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
233 aa  194  9e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0760186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  47.75 
 
 
246 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.07 
 
 
253 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  46.95 
 
 
241 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  43.04 
 
 
237 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  44.35 
 
 
239 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0188  ABC transporter related  42.01 
 
 
226 aa  193  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0183  ABC transporter related  42.01 
 
 
226 aa  193  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.337585  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.07 
 
 
253 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  44.49 
 
 
238 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  45.25 
 
 
237 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.34 
 
 
225 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  45.41 
 
 
230 aa  192  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  44.55 
 
 
237 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  44.55 
 
 
237 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 
234 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.29 
 
 
234 aa  192  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  46.12 
 
 
235 aa  192  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  45.93 
 
 
240 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  45.93 
 
 
240 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  44.29 
 
 
238 aa  191  7e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.89 
 
 
648 aa  191  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  45.29 
 
 
226 aa  191  9e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.6 
 
 
253 aa  191  9e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.06 
 
 
235 aa  191  9e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3559  ABC transporter related  47 
 
 
239 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 
253 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  42.06 
 
 
642 aa  191  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  41.63 
 
 
260 aa  190  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  44.09 
 
 
236 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.91 
 
 
235 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  42.15 
 
 
238 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  42.52 
 
 
236 aa  191  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  41.26 
 
 
643 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  46.15 
 
 
227 aa  190  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 
232 aa  190  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  45.02 
 
 
230 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  44.84 
 
 
238 aa  190  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  42.61 
 
 
244 aa  190  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  46.67 
 
 
239 aa  189  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.98 
 
 
242 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  42.67 
 
 
226 aa  189  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  41.96 
 
 
230 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.86 
 
 
227 aa  190  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.98 
 
 
242 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
228 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  46.98 
 
 
244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  45.21 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  42.79 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  43.78 
 
 
242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0892  ABC transporter related  50.24 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.783252 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.73 
 
 
233 aa  189  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  42.92 
 
 
241 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  44.91 
 
 
228 aa  189  4e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  44.44 
 
 
231 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.29 
 
 
678 aa  188  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  44.29 
 
 
678 aa  188  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 
228 aa  189  5e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  44.29 
 
 
678 aa  189  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60790  ABC transporter ATP-binding protein  44.34 
 
 
228 aa  188  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  45.45 
 
 
240 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  47.95 
 
 
242 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  44.5 
 
 
288 aa  188  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  42.47 
 
 
233 aa  187  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  42.04 
 
 
240 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
226 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  43.48 
 
 
249 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  43.44 
 
 
226 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
226 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
226 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  42.08 
 
 
253 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
233 aa  187  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  43.44 
 
 
226 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 
221 aa  186  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 
248 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
227 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 
249 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  46.36 
 
 
241 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  45.5 
 
 
228 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.41 
 
 
249 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  45.07 
 
 
241 aa  186  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.44 
 
 
249 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 
240 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 
240 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>