More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_07024 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_07024  transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  542  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000974  response regulator of the LytR/AlgR family  98.86 
 
 		 263 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.728867  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0387  response regulator  55.17 
 
 		 261 aa  305  6e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1381  LytR/AlgR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 273 aa  216  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0421  two component transcriptional regulator, LytTR family  45.21 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1965  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  42.55 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2443  LytTR family two component transcriptional regulator  42.69 
 
 		 279 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1290  two component transcriptional regulator, LytTR family  42.18 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.212023 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1227  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.45 
 
 		 277 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299238  normal  0.813842 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1352  two-component response regulator transcription regulator protein  42.91 
 
 		 270 aa  201  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1400  response regulator  41.15 
 
 		 243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2262  LytTR family two component transcriptional regulator  42.7 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0894174 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2035  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 282 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2603  response regulator  39.23 
 
 		 243 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1069  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.99 
 
 		 276 aa  185  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2282  response regulator receiver protein  39.49 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3613  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.58 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6684  LytR/AlgR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 243 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.48 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1148  response regulator receiver protein  42.17 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 255 aa  148  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  33.33 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.5 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  32.6 
 
 		 272 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3594  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.6 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833136  normal  0.0457058 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  34.09 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2186  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.57 
 
 		 275 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0097  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4386  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.89 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.46 
 
 		 266 aa  135  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  34.72 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0036  LytR/AlgR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3668  two-component response regulator AlgR  34.3 
 
 		 243 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00827536  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  35.08 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0231  LytR/AlgR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  31.3 
 
 		 266 aa  132  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  31.27 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.82 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04138  two-component system regulatory protein  37.67 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  33.04 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  32.96 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3718  response regulator  31.37 
 
 		 275 aa  129  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1226  LytTR family two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  32.28 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0190  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.625509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4382  LytTR family two component transcriptional regulator  29.52 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  29.12 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1259  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  29.73 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  29.73 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1373  DNA-binding response regulator  56.88 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.648551  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  32.94 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3679  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.74 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.05 
 
 		 244 aa  125  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  29.39 
 
 		 245 aa  125  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 257 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1279  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.91 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0127  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  31.78 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.35 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  30 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  28.35 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  28.35 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.37 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  32.7 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  34.1 
 
 		 253 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0063  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  31.36 
 
 		 248 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.94 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5598  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.05 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000105391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  31.1 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0957  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.86 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6007  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  32.2 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.18 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1879  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.34 
 
 		 249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.247337  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0254  response regulator  29.62 
 
 		 251 aa  119  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  31.92 
 
 		 268 aa  118  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0671  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.07 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2171  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.34 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0294549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69470  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  31.91 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.184834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.49 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  28.96 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0279  two-component response regulator AlgR  30.51 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  31.33 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4134  LytTR family two component transcriptional regulator  35.08 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.291369  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1458  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 140 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.19 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  28.19 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2533  response regulator  28.19 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  28.19 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  33.33 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  28.19 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>