More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_07011 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  100 
 
 
189 aa  384  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  37.77 
 
 
193 aa  121  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 
193 aa  120  9e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  35.98 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 
191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 
205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 
600 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  35.91 
 
 
186 aa  107  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  34.62 
 
 
186 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 
193 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
197 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 
192 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
188 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 
193 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
188 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
188 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
188 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
188 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
188 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  37.93 
 
 
179 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 
216 aa  99  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
187 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
187 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
188 aa  98.6  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
187 aa  97.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
187 aa  97.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
188 aa  98.2  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
188 aa  94.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
190 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
198 aa  92.4  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
196 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
187 aa  90.9  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
181 aa  89.4  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
186 aa  88.6  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
187 aa  88.2  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
188 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  33.33 
 
 
176 aa  88.2  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 
211 aa  87  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 
196 aa  84.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
187 aa  84.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
198 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  31.65 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  29.59 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 
167 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
198 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
181 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
212 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
195 aa  58.2  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  34.02 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  36.47 
 
 
207 aa  56.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1070  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
229 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
225 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  25.56 
 
 
196 aa  55.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
193 aa  55.1  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 
208 aa  54.7  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 
196 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 
201 aa  53.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  24.4 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  35.16 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  34.57 
 
 
214 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
235 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
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NC_009719  Plav_1950  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
248 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
235 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0903799 
 
 
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NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
197 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
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NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
215 aa  52.4  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 
194 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
212 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
212 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  23.5 
 
 
199 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.403978 
 
 
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NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
212 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
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NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
235 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
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NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
239 aa  52  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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