167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06994 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  404  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  94.55 
 
 		 202 aa  363  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  54.17 
 
 		 204 aa  207  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  52.36 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  52.36 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  50.76 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  52.33 
 
 		 204 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  52.08 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  52.08 
 
 		 208 aa  201  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  52.08 
 
 		 208 aa  201  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  53.12 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  49.74 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  50 
 
 		 204 aa  197  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  51.83 
 
 		 215 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  50.51 
 
 		 211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  46.07 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  49.23 
 
 		 203 aa  184  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  50.26 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  46.07 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  47.96 
 
 		 202 aa  177  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  48.45 
 
 		 205 aa  177  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  45.88 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  45.55 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  48.19 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  47.94 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  48.69 
 
 		 210 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  46.07 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  47.94 
 
 		 198 aa  168  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  44.1 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  43.98 
 
 		 235 aa  164  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  45.55 
 
 		 237 aa  164  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  45.08 
 
 		 234 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  43.23 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  46.07 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  42.71 
 
 		 228 aa  158  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  43.46 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  45.55 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  41.75 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  40.59 
 
 		 237 aa  154  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  42.41 
 
 		 238 aa  151  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  39.79 
 
 		 200 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  39.79 
 
 		 204 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  39.79 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  38.14 
 
 		 208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  41.03 
 
 		 202 aa  144  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  40.21 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  46.07 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  46.6 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  46.07 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  44.56 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  37.5 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  32.81 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  37.5 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  38.51 
 
 		 239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  35.94 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  36.9 
 
 		 200 aa  107  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  32.84 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  51.55 
 
 		 109 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  35.42 
 
 		 229 aa  95.9  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  29.33 
 
 		 287 aa  68.2  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  27.98 
 
 		 279 aa  67.8  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  27.04 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  29.71 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  29.63 
 
 		 314 aa  65.5  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  28.4 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1953  YitT family protein  25.95 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2107  Protein of unknown function DUF2179  27.92 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0670026 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  28.17 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  27.27 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  31.1 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2061  protein of unknown function DUF161  28.4 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.512789  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  29.32 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  31.68 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  27.44 
 
 		 299 aa  58.2  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2849  protein of unknown function DUF161  27.17 
 
 		 288 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1201  protein of unknown function DUF161  29.01 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895465 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  31.71 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0760  hypothetical protein  29.19 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455591  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  28.85 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  29.68 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  26.47 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3612  hypothetical protein  28.67 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  25.77 
 
 		 322 aa  55.1  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  29.01 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  26.83 
 
 		 289 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  28.28 
 
 		 311 aa  54.7  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1826  hypothetical protein  24.86 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1586  hypothetical protein  25.49 
 
 		 293 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3759  hypothetical protein  25.49 
 
 		 293 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  26.83 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0072  hypothetical protein  26.99 
 
 		 287 aa  53.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1658  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1440  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00353544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1412  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000497334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1413  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1624  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.459527 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1553  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  28.77 
 
 		 296 aa  52.8  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1308  hypothetical protein  26.47 
 
 		 288 aa  52.4  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.493117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>