123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06957 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  590  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  86.52 
 
 		 285 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  59.72 
 
 		 283 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  26.79 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  26.69 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  28.77 
 
 		 287 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  26.98 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  26.49 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  27.34 
 
 		 294 aa  89  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  27.34 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  28.96 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  26.34 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  29.02 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  26.19 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  27.62 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  28.17 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  25.26 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  25.71 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  24.25 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  26.79 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  23.02 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  26.76 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  24.04 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  26.98 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  26.57 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  31.98 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  25.94 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  25.29 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  25.93 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  25.58 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  26.17 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  24.33 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  26.67 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  25.7 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  25.91 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  27.69 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  34.17 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  36.08 
 
 		 347 aa  53.5  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  21.66 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  38.27 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 		 253 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  22.27 
 
 		 326 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  34.83 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  35.8 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2720  hypothetical protein  30.49 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2593  hypothetical protein  30.49 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 		 350 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 254 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  24.87 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  38.82 
 
 		 289 aa  46.6  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0384  hypothetical protein  25 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  23.08 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 250 aa  46.2  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 291 aa  45.8  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1208  Alpha/beta hydrolase  35.48 
 
 		 273 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  22.53 
 
 		 316 aa  45.8  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 288 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 		 294 aa  45.8  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 288 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  29.46 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  31.11 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.77 
 
 		 374 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  19.89 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  22.6 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 361 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  28.34 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.76 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  35.14 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  31.36 
 
 		 456 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  23.76 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  35.29 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  38.16 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  30.65 
 
 		 380 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  22.22 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0144  hydrolase, alpha/beta fold family protein  29.13 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.261778  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  35.65 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0419558 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>