More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06903 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  100 
 
 		 341 aa  695    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  92.93 
 
 		 311 aa  559  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  44.7 
 
 		 354 aa  279  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  37.61 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  37.31 
 
 		 331 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0434  secretion protein HlyD family protein  37.97 
 
 		 337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.532566  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0257  secretion protein, HlyD family  37.97 
 
 		 337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  34.14 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  35.78 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  33.52 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  35.81 
 
 		 368 aa  185  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  34.69 
 
 		 355 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  34.32 
 
 		 372 aa  182  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  34.9 
 
 		 352 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  34.95 
 
 		 374 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  37.27 
 
 		 383 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  34.9 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  34.9 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  33.06 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  34.4 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  34.62 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  33.73 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 375 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  34.9 
 
 		 352 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  36.62 
 
 		 393 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  33.63 
 
 		 387 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  35.01 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  35.31 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  33.04 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  33.63 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  33.54 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  35.1 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  35.28 
 
 		 356 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  33.02 
 
 		 368 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  33.23 
 
 		 366 aa  175  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  33.43 
 
 		 351 aa  175  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  37.88 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  33.43 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  34.13 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  31.75 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  34.79 
 
 		 443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  33.43 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  34.81 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  34.2 
 
 		 365 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  33.92 
 
 		 380 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  33.91 
 
 		 351 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  34.43 
 
 		 351 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0487  secretion protein HlyD  35.22 
 
 		 387 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  34.32 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  34.84 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  33.82 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  34.29 
 
 		 413 aa  170  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  35.06 
 
 		 380 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  36.1 
 
 		 470 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  36.67 
 
 		 371 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  35.99 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  36.1 
 
 		 475 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  36.1 
 
 		 475 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  34.86 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  35.1 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  33.62 
 
 		 347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0616  secretion protein HlyD  33.23 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  34.73 
 
 		 380 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  36.39 
 
 		 400 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  33.54 
 
 		 349 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  35.28 
 
 		 390 aa  165  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3599  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  33.62 
 
 		 387 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0273562 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2737  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  33.62 
 
 		 387 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.778541  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02278  EmrKY-TolC multidrug resistance efflux pump, membrane fusion protein component  33.62 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.29421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1289  efflux pump membrane protein  33.62 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2505  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  33.62 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.012377  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  34.91 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1301  efflux pump membrane protein  33.62 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.632829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  34.58 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02239  hypothetical protein  33.62 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  33.43 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  34.91 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  34.44 
 
 		 363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  32.81 
 
 		 394 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  33.63 
 
 		 352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  35.06 
 
 		 413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  34.96 
 
 		 468 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0097  secretion protein HlyD family protein  32.89 
 
 		 354 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2518  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  33.33 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  33.75 
 
 		 348 aa  162  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  32.53 
 
 		 402 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2654  drug resistance MFS transporter, membrane fusion protein (MFP) subunit EmrK  33.33 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  32.19 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0858  efflux pump membrane protein  34.63 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  35.31 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  34.29 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  32.48 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  32.44 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  36.18 
 
 		 383 aa  160  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  32.48 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7637  efflux pump protein  33.11 
 
 		 385 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  32.46 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  32.26 
 
 		 377 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  33.72 
 
 		 380 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>