96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06892 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06892  methylmalonyl CoA epimerase  100 
 
 
139 aa  285  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000895  lactoylglutathione lyase  75.19 
 
 
141 aa  216  7.999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3213  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.88 
 
 
136 aa  173  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2248  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.3 
 
 
135 aa  150  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.887282  normal  0.86404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29360  glyoxalase, Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  52.76 
 
 
135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2966  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.85 
 
 
141 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.422246 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3956  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.94 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000520139  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2568  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.54 
 
 
139 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.476855  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3147  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.54 
 
 
139 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3300  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.54 
 
 
139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3153  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.39 
 
 
137 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.0000000000010528  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.39 
 
 
137 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310756  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3172  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.39 
 
 
137 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657624  decreased coverage  0.000000082582 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3206  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.39 
 
 
143 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000404623  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3090  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.39 
 
 
137 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000152154  decreased coverage  0.00078643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6509  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.61 
 
 
137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000178969  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2299  glyoxalase family protein  49.61 
 
 
138 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000195056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0115  glyoxalase family protein  49.61 
 
 
138 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000344124  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2248  glyoxalase family protein  49.61 
 
 
138 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000384082  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2837  glyoxalase family protein  49.61 
 
 
138 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000107738  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0131  glyoxalase family protein  49.61 
 
 
138 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.0000275668  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0120  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.09 
 
 
145 aa  130  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0321  glyoxalase family protein  49.61 
 
 
138 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000322119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2322  glyoxalase family protein  49.61 
 
 
138 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000000100252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0114  glyoxalase family protein  49.61 
 
 
138 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.000000000210861  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4481  putative lactoylglutathione lyase  50.39 
 
 
141 aa  130  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298655  unclonable  0.00000133457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3146  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.03 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.0000000000000451164  unclonable  0.00000000000414135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3398  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.16 
 
 
136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2605  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.29 
 
 
144 aa  128  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123177  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3236  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.16 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.912407  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3089  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.19 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000507937  unclonable  0.00000000000000144798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0084  glyoxalase family protein  48.84 
 
 
138 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000575972  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4885  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.19 
 
 
150 aa  121  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.08 
 
 
137 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127452  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0144  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.84 
 
 
137 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31640  putative ring-cleaving dioxygenase  45.19 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.195652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2691  putative ring-cleaving dioxygenase  46.21 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.09 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0848  hypothetical protein  31.01 
 
 
128 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1685  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.34 
 
 
127 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0022  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2211  30S ribosomal protein S15  30.43 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2195  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.85 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.811141  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0360  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.78 
 
 
129 aa  51.2  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0037  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.91 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2573  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.87 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149975  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1001  extradiol ring-cleaving dioxygenase, putative  31.54 
 
 
128 aa  50.4  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0362  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.41 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.604998  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0943  putative extradiol ring-cleaving dioxygenase  31.54 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7861  hypothetical protein  26.87 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.433206 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0045  ring-cleaving dioxygenase  32.82 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.985794  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5200  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dihydroxybiphenyl dioxygenase  29.93 
 
 
201 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000172312  normal  0.0747764 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0952  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.81 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1772  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 
204 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4359  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  hitchhiker  0.00717168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2855  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
147 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3471  hypothetical protein  31.85 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0299  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.76 
 
 
200 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0377  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.91 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0524594  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1454  glutathione S-transferase, fosfomycin resistance protein, putative  26.36 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.137166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2716  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.47 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.03 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1277  hitchhiker  0.00852425 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27002  predicted protein  27.82 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00346607  normal  0.11675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.6 
 
 
201 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1771  glutathione S-transferase, fosfomycin resistance protein, putative  25.56 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.154627 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0375  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.32 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.158959 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0308  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.32 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0496645  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3017  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.65 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.88 
 
 
182 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  27.82 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0410  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.87 
 
 
164 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.909465 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1474  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.3 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.781159  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1338  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.58 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.184325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0273  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.53 
 
 
206 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.56 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.930007  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0406  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.58 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0319088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0024  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.13 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0027  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 
204 aa  42  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0562097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3893  glyoxalase, putative  35.66 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222146  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4030  hypothetical protein  28.24 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.581742 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0011  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.71 
 
 
133 aa  41.2  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.708628  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0572  hypothetical protein  24.49 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal  0.0152096 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  27.07 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.69 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444424  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3736  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.15 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5014  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.03 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458223  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2351  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.82 
 
 
128 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.5 
 
 
204 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.281044  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2401  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.82 
 
 
128 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2894  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.03 
 
 
147 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0995  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.98 
 
 
163 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.44614  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0211  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.45 
 
 
122 aa  40.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.188471 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4899  metallothiol transferase FosB  31.5 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4049  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2795  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 
134 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111231  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.07 
 
 
134 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>