255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06857 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  608  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  86.01 
 
 		 299 aa  477  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  55.97 
 
 		 295 aa  326  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  43.32 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.4 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  47.52 
 
 		 289 aa  218  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  47.22 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.21 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  42.37 
 
 		 307 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.96 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.7 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  49.11 
 
 		 291 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  46.49 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  41.58 
 
 		 289 aa  206  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  46.13 
 
 		 291 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  46.26 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  45.76 
 
 		 292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  42.76 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  42.75 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  40.48 
 
 		 300 aa  192  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  42.76 
 
 		 283 aa  189  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  41.16 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  37.68 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.46 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  37.54 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  37.23 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  39.86 
 
 		 295 aa  179  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.36 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.46 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  35.76 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.64 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  39.18 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  39.16 
 
 		 296 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.11 
 
 		 296 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  38.16 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  36.97 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  36.27 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  34.77 
 
 		 317 aa  152  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.23 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  36.23 
 
 		 307 aa  149  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.85 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.93 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  32.74 
 
 		 325 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  33.57 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  32.06 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  32.47 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  32.47 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  32.26 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.1 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  33.21 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  30.5 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  34.48 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  31.58 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  31.14 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  31.14 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  28.33 
 
 		 305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  31.17 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2005  hypothetical protein  30.66 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0697  hypothetical protein  31.39 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.157594  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0762  hypothetical protein  31.39 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0587  hypothetical protein  31.39 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.256755  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1652  hypothetical protein  31.39 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.755611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2100  hypothetical protein  31.39 
 
 		 301 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0514  hypothetical protein  31.39 
 
 		 301 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  28.47 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0887  hypothetical protein  30.63 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  27.76 
 
 		 307 aa  99.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  27.34 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  29.39 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  28.82 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  29.06 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  29.06 
 
 		 295 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  29.06 
 
 		 295 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  28.67 
 
 		 287 aa  89  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3991  hypothetical protein  29.37 
 
 		 287 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29070  hypothetical protein  29.02 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  29.26 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.25 
 
 		 305 aa  86.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1803  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  26.78 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  28.32 
 
 		 312 aa  85.9  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  26.07 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5276  hypothetical protein  28.29 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.69166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3356  hypothetical protein  28.63 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5011  hypothetical protein  28.63 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3679  membrane protein  28.73 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4424  hypothetical protein  27.45 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325895 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  27.46 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  27.44 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  26.58 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3869  hypothetical protein  29.59 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751043  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  26.25 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  27.38 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  27.82 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  29.39 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  27 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  27 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>