94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06754 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  545  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1055  putative membrane associated protease  61.65 
 
 		 275 aa  282  5.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.103731  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  56.23 
 
 		 276 aa  245  8e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  41.96 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  38.3 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  46.15 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  51.28 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  51.28 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  51.28 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  48.26 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  50.52 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  50.52 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  40.27 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  40.27 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  40.27 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  40.27 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  40.27 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  40.27 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  40.27 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  39.17 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.351592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  39.13 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  36.77 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  39.13 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1390  CAAX protease family protein  40.72 
 
 		 412 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5732  abortive infection protein  39.23 
 
 		 281 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51176  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6485  abortive infection protein  38.46 
 
 		 281 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1322  abortive infection protein  38.07 
 
 		 288 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1834  abortive infection protein  38.21 
 
 		 263 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3405  abortive infection protein  36.14 
 
 		 265 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  35.9 
 
 		 252 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  31.58 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  31.58 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  36.04 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4130  abortive infection protein  32.86 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110125  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3843  abortive infection protein  41.18 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4525  abortive infection protein  41.18 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5779  abortive infection protein  40.69 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1056  hypothetical protein  32.84 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.699791 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  31.68 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1408  abortive infection protein  38.96 
 
 		 187 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000101679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  29.81 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  30.77 
 
 		 288 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3350  ferrous iron transport protein B  25.98 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0269256  normal  0.0624529 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  38.37 
 
 		 420 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  29.81 
 
 		 237 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  35.05 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2677  abortive infection protein  38.95 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.850809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2327  abortive infection protein  34.88 
 
 		 225 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3804  CAAX amino terminal protease family protein  38.96 
 
 		 187 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000276045  hitchhiker  1.95996e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1580  CAAX amino terminal protease family protein  38.96 
 
 		 187 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.2764399999999996e-39 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1367  CAAX amino terminal protease family protein  38.96 
 
 		 188 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000155141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1368  CAAX amino terminal protease family protein  38.96 
 
 		 187 aa  49.3  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.63471e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1647  CAAX amino terminal protease family protein  38.96 
 
 		 187 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000557055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1541  CAAX amino terminal protease family protein  38.96 
 
 		 187 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1395  CAAX amino terminal protease family protein  38.96 
 
 		 187 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000488789  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1506  CAAX amino terminal protease family protein  38.96 
 
 		 187 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000177137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1611  CAAX amino terminal protease family protein  38.96 
 
 		 170 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000156991  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  30.59 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1209  abortive infection protein  36.36 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  32.94 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05801  membrane-associated protease  38.36 
 
 		 452 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  37.5 
 
 		 420 aa  47.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  31.37 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  35.16 
 
 		 241 aa  47  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  31.65 
 
 		 292 aa  46.2  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  34.62 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  32.86 
 
 		 264 aa  45.4  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  33.33 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  33.98 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  32.91 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1135  abortive infection protein  39.08 
 
 		 180 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0516  membrane associated protease-like  35.62 
 
 		 453 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  29.41 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  26.47 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  35.62 
 
 		 453 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  29.9 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  30 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0098  abortive infection protein  33.33 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.015853  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  31.18 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  30.38 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  31.18 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1625  abortive infection protein  32 
 
 		 414 aa  43.5  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 		 337 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  30 
 
 		 337 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  30 
 
 		 337 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  30 
 
 		 337 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  33.56 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  36.36 
 
 		 338 aa  42.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  37.33 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  30.38 
 
 		 313 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  30.38 
 
 		 337 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  30 
 
 		 312 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  32.88 
 
 		 261 aa  42.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 276 aa  42.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>