148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06741 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06741  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  667    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000832  outer membrane protein C precursor  49.85 
 
 		 331 aa  297  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0331596  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001437  non-specific porin  43.14 
 
 		 352 aa  262  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.524484  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06284  hypothetical protein  44.19 
 
 		 352 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0427  putative outer membrane pore protein  41.95 
 
 		 340 aa  249  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0666  porin  39.82 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00111405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04813  hypothetical protein  27.27 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2229  porin  26.08 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218103  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05099  porin  29.83 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2283  porin  26.01 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2557  porin  24.17 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3084  porin  26.11 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  decreased coverage  0.00000268212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1487  porin  27.25 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911374 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001232  outer membrane protein OmpU  31.76 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0870457  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3060  outer membrane porin, putative  26.05 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1515  porin  29.44 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000337456  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2654  porin  30.22 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157647  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0276  porin  23.53 
 
 		 384 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3873  porin  23.53 
 
 		 384 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2434  porin  26.25 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.775403  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001436  non-specific porin  29.2 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154506  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06287  hypothetical protein  30 
 
 		 322 aa  67  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0680  porin  30.22 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.424836  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2628  porin  25 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000106502  hitchhiker  0.00000892589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3669  porin  23.79 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3366  porin  26.95 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0312  outer membrane porin, putative  23.79 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1631  porin  25.95 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000133613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2481  porin  22.73 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000211873  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2795  outer membrane porin protein C  28.05 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00922509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1641  outer membrane protein N  25.25 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  0.976453 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2723  porin Gram-negative type  26.24 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000866519  hitchhiker  0.00000818773 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0230  putative outer membrane protein  22.06 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2468  porin  24.38 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000293387  hitchhiker  0.000118178 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1821  outer membrane porin, putative  25.9 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2536  porin  24.38 
 
 		 402 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000566311  unclonable  0.0000300208 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1620  porin  28.33 
 
 		 403 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000207941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1654  porin  28.33 
 
 		 403 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000730706  normal  0.12603 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  30.05 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3603  porin  27.78 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000908733  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0572  outer membrane protein, putative porin  24.58 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3681  porin  24.23 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1679  porin  25.47 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512961  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2761  outer membrane porin protein C  27.5 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000019147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3264  outer membrane porin protein C  27.51 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00668257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1444  outer membrane porin protein C  27.5 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000996913  normal  0.640308 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2839  outer membrane porin protein C  27.5 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2197  outer membrane protein  27.46 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4086  porin  23.1 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1448  porin  24.67 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0593743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3977  porin Gram-negative type  23.1 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4173  porin  23.1 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1221  porin family protein  31.31 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1568  porin  29.12 
 
 		 403 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  hitchhiker  0.00000152354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4055  porin  23.1 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3336  outer membrane porin, putative  25.67 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1689  outer membrane porin protein LC  25.35 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1770  outer membrane porin protein LC  24.82 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1750  outer membrane porin protein LC  25.35 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1687  outer membrane porin protein LC  25.35 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.535168 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1251  outer membrane porin, putative  24.43 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000429036  hitchhiker  0.000137517 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1474  porin  23.68 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2507  outer membrane porin protein C  26.27 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2610  outer membrane porin protein C  26.27 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.440954 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2451  outer membrane porin protein C  26.27 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487875 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002599  outer membrane protein OmpU  26.64 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0233564  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0282  porin  26.4 
 
 		 348 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2493  outer membrane porin protein C  26.27 
 
 		 378 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2472  porin  25.1 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0827968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2559  outer membrane protein F  25.72 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000037634  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2649  porin  25.63 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2083  gram-negative porin family protein  27.43 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1702  porin family protein  27.43 
 
 		 366 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0189246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3847  porin  25.61 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3663  porin  26.4 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2057  porin  25.36 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2839  porin  29.74 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1979  outer membrane protein F  25.63 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000261923  normal  0.629044 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2403  outer membrane porin protein C  25.99 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00624536  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0767  outer membrane phosphoporin protein E  25.68 
 
 		 350 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1582  outer membrane protein N  25.25 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.640646  normal  0.720278 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1064  outer membrane protein F  26.42 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219898 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1114  outer membrane protein F  26.42 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0339552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1006  outer membrane protein F  26.42 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00715949  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1032  outer membrane protein F  26.42 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.847393  normal  0.0115184 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03408  hypothetical protein  27.2 
 
 		 337 aa  53.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1097  outer membrane protein F  26.42 
 
 		 363 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.918744 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1701  outer membrane protein N  25.43 
 
 		 388 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1870  outer membrane protein N  25.25 
 
 		 383 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.098119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1730  porin  30.53 
 
 		 369 aa  52.8  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00293132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0295  outer membrane phosphoporin protein E  25.33 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372368 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2778  outer membrane protein N  25.74 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.704962  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0286  outer membrane phosphoporin protein E  24.89 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172379  normal  0.530203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0273  outer membrane phosphoporin protein E  24.89 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.664027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1322  outer membrane protein C2  25.74 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2857  porin  25.74 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454817  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1665  porin Gram-negative type  27.27 
 
 		 376 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000257252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00238  outer membrane phosphoporin protein E  24.89 
 
 		 345 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.86907  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0268  outer membrane phosphoporin protein E  25.22 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00241  hypothetical protein  24.89 
 
 		 345 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.693331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>