More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06683 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  622  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  90.07 
 
 		 307 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  56.48 
 
 		 303 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  57.48 
 
 		 298 aa  362  4e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  57.19 
 
 		 295 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  57 
 
 		 299 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  56.8 
 
 		 298 aa  362  6e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  56.31 
 
 		 296 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  55.96 
 
 		 335 aa  356  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  55.97 
 
 		 298 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  55.97 
 
 		 298 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  55.29 
 
 		 298 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  54.42 
 
 		 298 aa  350  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  51.17 
 
 		 299 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4209  LysR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 304 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  47.84 
 
 		 305 aa  305  8.000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  42.21 
 
 		 309 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 304 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  43.34 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  40.34 
 
 		 297 aa  255  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 307 aa  255  8e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 301 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1541  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.827921  normal  0.805114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2979  transcriptional regulator, LysR family  43.19 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438714  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2122  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  39.86 
 
 		 305 aa  242  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.87 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 322 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1266  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.50212  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  40.92 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2289  transcriptional regulator, LysR family  40.55 
 
 		 353 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1543  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 299 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0137  LysR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 302 aa  238  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 303 aa  238  6.999999999999999e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  38.8 
 
 		 299 aa  237  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  36.91 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1192  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2458  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115527  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  36.91 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0934  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1373  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.260945  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0637  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0359  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475438  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 304 aa  236  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 313 aa  236  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 300 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2531  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 299 aa  235  9e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2192  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1971  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 355 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0831  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 298 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 351 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 351 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 351 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 351 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  40.14 
 
 		 351 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 351 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 351 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 302 aa  231  9e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4278  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1836  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.471013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  42.11 
 
 		 303 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 310 aa  229  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 289 aa  229  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  39.08 
 
 		 289 aa  229  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3222  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 305 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2326  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 317 aa  228  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231935  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 304 aa  228  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4938  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 305 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4475  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 301 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0155  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 312 aa  228  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0458494  normal  0.226334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 292 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2967  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0980  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 304 aa  227  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.926396 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2987  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  38.6 
 
 		 289 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2353  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884603  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0031  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>