31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06572 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06572  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  173  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0576  glpM protein  76.4 
 
 		 116 aa  138  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4424  GlpM family protein  64.29 
 
 		 113 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4143  GlpM family protein  63.1 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2468  GlpM family protein  59.49 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.691843  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2050  GlpM protein  56.82 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00204107  hitchhiker  0.00420022 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1845  GlpM family protein  58.23 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.038453 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2255  GlpM protein  57.65 
 
 		 113 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000704437  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2358  GlpM family protein  57.65 
 
 		 113 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2036  GlpM family protein  57.69 
 
 		 111 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000115017  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01566  hypothetical protein  57.69 
 
 		 111 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2316  hypothetical protein  57.69 
 
 		 111 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.129609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1792  hypothetical protein  57.69 
 
 		 111 aa  98.6  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0167056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2023  GlpM family protein  57.69 
 
 		 111 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01576  conserved inner membrane protein associated with alginate biosynthesis  57.69 
 
 		 111 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.612551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1682  hypothetical protein  57.69 
 
 		 111 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.415334  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1814  hypothetical protein  57.69 
 
 		 111 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0297907  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1593  hypothetical protein  57.69 
 
 		 111 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0586032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4541  GlpM  51.19 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.300436  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1576  GlpM family protein  54.43 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156929 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1698  GlpM protein  54.43 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0695256  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1644  GlpM family protein  54.43 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.345737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1585  GlpM family protein  54.43 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.16158  normal  0.77266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1106  GlpM family protein  53.57 
 
 		 111 aa  93.2  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659945  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1065  GlpM family protein  53.57 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4347  GlpM family protein  52.38 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2378  GlpM family protein  59.38 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.478096  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1558  membrane protein GlpM  48.81 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17920  membrane protein GlpM  50 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0965  hypothetical protein  44.74 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.112689  unclonable  0.0000287605 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2476  GlpM protein  29.76 
 
 		 117 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>