148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06535 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  82.88 
 
 		 802 aa  1433    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  100 
 
 		 802 aa  1682    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  41.66 
 
 		 819 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  41.75 
 
 		 819 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  41.23 
 
 		 815 aa  620  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  39.8 
 
 		 824 aa  610  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  34.75 
 
 		 845 aa  491  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.44 
 
 		 845 aa  486  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  33.72 
 
 		 864 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  37.41 
 
 		 871 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  34.03 
 
 		 863 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  31.96 
 
 		 860 aa  432  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.29 
 
 		 842 aa  429  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  32.55 
 
 		 891 aa  419  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  34.97 
 
 		 891 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  35.03 
 
 		 897 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  30.48 
 
 		 875 aa  389  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  32.6 
 
 		 813 aa  388  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.22 
 
 		 872 aa  382  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  34.9 
 
 		 840 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.27 
 
 		 813 aa  379  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  31.84 
 
 		 793 aa  370  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  30.52 
 
 		 786 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  31.12 
 
 		 785 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  29.57 
 
 		 861 aa  361  3e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  29.87 
 
 		 812 aa  351  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  33.33 
 
 		 824 aa  350  5e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  30.71 
 
 		 829 aa  350  5e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  29.92 
 
 		 831 aa  350  5e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  30.63 
 
 		 819 aa  345  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  30.96 
 
 		 823 aa  345  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.21 
 
 		 818 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.43 
 
 		 843 aa  342  2e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.73 
 
 		 817 aa  340  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  35.33 
 
 		 799 aa  337  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  30.51 
 
 		 833 aa  333  7.000000000000001e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  30.24 
 
 		 839 aa  329  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  29.43 
 
 		 843 aa  325  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  28.35 
 
 		 837 aa  325  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.87 
 
 		 835 aa  320  7e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  29.87 
 
 		 846 aa  311  4e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  29.87 
 
 		 880 aa  300  7e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  30.1 
 
 		 847 aa  290  8e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  26.71 
 
 		 837 aa  278  4e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  30.82 
 
 		 838 aa  275  2.0000000000000002e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  26.65 
 
 		 940 aa  243  9e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  35.88 
 
 		 663 aa  227  7e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.02 
 
 		 826 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  23.55 
 
 		 845 aa  173  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  24.81 
 
 		 821 aa  170  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.63 
 
 		 826 aa  170  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  28.76 
 
 		 839 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  28.76 
 
 		 839 aa  154  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  28.76 
 
 		 839 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  28.76 
 
 		 839 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  28.76 
 
 		 839 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  28.76 
 
 		 839 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  28.76 
 
 		 839 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  24.62 
 
 		 820 aa  148  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 		 816 aa  146  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  27.23 
 
 		 763 aa  146  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  27.39 
 
 		 839 aa  146  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  24.92 
 
 		 882 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  24.64 
 
 		 882 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  23.34 
 
 		 811 aa  139  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  24.65 
 
 		 827 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.05 
 
 		 744 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  25.55 
 
 		 816 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  21.96 
 
 		 984 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.62 
 
 		 878 aa  130  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  25 
 
 		 812 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  25 
 
 		 828 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  25 
 
 		 828 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  25 
 
 		 828 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  26.64 
 
 		 825 aa  124  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  24.45 
 
 		 853 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  23.56 
 
 		 856 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.9 
 
 		 720 aa  109  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  23.98 
 
 		 962 aa  108  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 		 724 aa  107  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  23.71 
 
 		 815 aa  106  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.28 
 
 		 971 aa  102  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  24.2 
 
 		 739 aa  94.7  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  22.66 
 
 		 1144 aa  89  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  22.98 
 
 		 734 aa  87.8  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.83 
 
 		 1362 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.02 
 
 		 623 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  23.94 
 
 		 1270 aa  69.7  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  21.79 
 
 		 564 aa  63.9  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  23.46 
 
 		 906 aa  61.2  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2844  hypothetical protein  24.83 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  21.85 
 
 		 563 aa  60.1  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0523  hypothetical protein  26.61 
 
 		 278 aa  57  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  24.1 
 
 		 859 aa  56.6  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  21.99 
 
 		 607 aa  56.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.76 
 
 		 1033 aa  55.1  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  26.07 
 
 		 613 aa  55.1  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3078  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.07 
 
 		 609 aa  54.7  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  22.77 
 
 		 603 aa  53.5  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  22.08 
 
 		 1019 aa  53.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>