36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06528 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06528  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  360  7.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1062  membrane protein  66.48 
 
 		 182 aa  243  8e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166999  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06525  hypothetical protein  62.12 
 
 		 135 aa  182  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4643  hypothetical protein  38.95 
 
 		 195 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155157  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1317  hypothetical protein  41.3 
 
 		 187 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.521983  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6778  hypothetical protein  38.95 
 
 		 195 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2020  hypothetical protein  41.24 
 
 		 206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618723 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1445  putative inner membrane protein  41.24 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.436473 
 
 
-
 
NC_003296  RS04712  hypothetical protein  42.7 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2012  hypothetical protein  41.81 
 
 		 206 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.392737  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2074  hypothetical protein  41.81 
 
 		 204 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0450  hypothetical protein  40 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0474  hypothetical protein  39.41 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3287  hypothetical protein  34.22 
 
 		 197 aa  95.5  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.671731  hitchhiker  0.0042483 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0324  putative disulfide bond formation protein DsbB  34.16 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0357  disulfide bond formation protein DsbB, putative  34.16 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3828  disulphide bond formation protein DsbB  27.78 
 
 		 482 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3914  disulphide bond formation protein DsbB  27.08 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1256  disulfide bond formation protein DsbB, putative  29.48 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.521027  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1681  DsbB family disulfide bond formation protein  29.87 
 
 		 504 aa  64.7  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1512  disulfide bond formation protein, DsbB family  28.38 
 
 		 505 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1646  DsbB family disulfide bond formation protein  26.74 
 
 		 499 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0944829  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2550  disulphide bond formation protein DsbB  24.66 
 
 		 478 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0017  DsbB family disulfide bond formation protein  27.61 
 
 		 508 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0044  DsbB family disulfide bond formation protein  26.75 
 
 		 508 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1346  disulfide bond formation protein, DsbB family  32.14 
 
 		 528 aa  53.5  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.29334  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0017  DsbB family disulfide bond formation protein  26.75 
 
 		 508 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3018  DsbB family disulfide bond formation protein  29.23 
 
 		 1210 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  38.64 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  32.53 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  45 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  29.76 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  28.48 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3658  disulphide bond formation protein DsbB  22.76 
 
 		 478 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0287  disulphide bond formation protein DsbB  22.76 
 
 		 478 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0483  Disulphide bond formation protein DsbB  37.5 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.351521  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>