134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06465 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06465  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  642    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000605  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  84.04 
 
 		 308 aa  553  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000153864  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0617  periplasmic solute binding protein  50.99 
 
 		 304 aa  314  9e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3141  adhesion protein, putative  49.64 
 
 		 302 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.452459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4333  periplasmic solute binding protein  48.18 
 
 		 303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0448  periplasmic solute binding protein  47.85 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158105  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0565  adhesion protein, putative  47.26 
 
 		 293 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3715  periplasmic solute binding protein  47.68 
 
 		 307 aa  296  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3741  periplasmic solute binding protein  47.44 
 
 		 302 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.434352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0527  periplasmic solute binding protein  47.1 
 
 		 302 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000427742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3798  periplasmic solute binding protein  47.1 
 
 		 302 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173939  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3924  periplasmic solute binding protein  47.1 
 
 		 302 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3310  periplasmic solute binding protein  47.06 
 
 		 302 aa  288  6e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0243618  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0567  periplasmic solute binding protein  47.96 
 
 		 302 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0566  periplasmic solute binding protein  47.96 
 
 		 302 aa  286  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0528  periplasmic solute binding protein  45.79 
 
 		 315 aa  285  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000128694  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3463  periplasmic solute binding protein  47.58 
 
 		 302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3516  periplasmic solute binding protein  47.96 
 
 		 288 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.996617  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2538  zinc/manganese transport system substrate-binding protein  41.09 
 
 		 297 aa  235  8e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.41437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0199  periplasmic solute binding protein  39.58 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3917  periplasmic solute binding protein  36.07 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247464  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1548  periplasmic solute binding protein  31.54 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000077382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1530  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1625  periplasmic solute binding protein  33.57 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.624808  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0051  periplasmic solute binding protein  31.3 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.958228  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2339  ABC metal ion transporter, periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.591821  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1535  periplasmic solute binding protein  36.11 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619757 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0972  periplasmic solute binding protein  32.1 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0180469  normal  0.0507696 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0490  periplasmic solute binding protein  32.11 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2435  periplasmic solute binding protein  29.77 
 
 		 308 aa  119  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0108745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3052  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  24.63 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  24.9 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  26.78 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1951  periplasmic solute binding protein  23.72 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0524661  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2141  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  24.42 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  24.1 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  26.11 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06745  hypothetical protein  22.18 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  20.58 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2115  periplasmic solute binding protein  29.59 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181464  normal  0.0892527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2090  periplasmic solute binding protein  29.59 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3927  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.51869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  29.78 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3801  periplasmic solute binding protein  29.59 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142921  normal  0.42718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  22.86 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1968  periplasmic solute binding protein  29.59 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427869 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000836  cation ABC transporter cation-binding protein  25.17 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  25.49 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  23.75 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  23.38 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  22.37 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  22.37 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  21.92 
 
 		 316 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  28.48 
 
 		 368 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  23.12 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  21.92 
 
 		 316 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  29.07 
 
 		 316 aa  52.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  23.18 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  21.92 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  24.09 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0860  periplasmic solute binding protein  24.19 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00530614  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  30.53 
 
 		 362 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  21.92 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  21.92 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  23.05 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  22.42 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 278 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0123  periplasmic solute binding protein  22.22 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.05 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  21.59 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  25.23 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  23.44 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  21.82 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  22.42 
 
 		 316 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  25.85 
 
 		 365 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  22.42 
 
 		 316 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33560  putative adhesion protein  28 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000392177  normal  0.054682 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  23.63 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  23.05 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  24.69 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  24.69 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  24.37 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2852  putative adhesion protein  28 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.07 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000130529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.07 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000251275  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  23.9 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  21.33 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  22.92 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  24.07 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  23.73 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  24.29 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.46 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000694266  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1248  periplasmic solute binding protein  23.72 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  26.34 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  24.49 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  25.25 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  27.56 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  24.42 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>